More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1335 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  100 
 
 		 245 aa  497  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  54.59 
 
 		 216 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  50.73 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  50.73 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  47.62 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  50 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  52.41 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  48.91 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  52.41 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  47.78 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 197 aa  172  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  47.12 
 
 		 198 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 198 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  49.19 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  47.42 
 
 		 207 aa  168  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 240 aa  168  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 199 aa  168  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  44.22 
 
 		 214 aa  168  9e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  48.4 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 207 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  49.46 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  165  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 198 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  46.03 
 
 		 219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  41.98 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  46.94 
 
 		 214 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  50.54 
 
 		 199 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  46.43 
 
 		 217 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  45.55 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  50 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  46.43 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  47.83 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  48.19 
 
 		 217 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  47.57 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  48.65 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  48.13 
 
 		 210 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  163  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  46.43 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  48.92 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  46.43 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  48.92 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  46.43 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  50 
 
 		 207 aa  162  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 198 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 218 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  48.68 
 
 		 235 aa  161  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 248 aa  161  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  44.92 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  48.21 
 
 		 211 aa  161  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  46.81 
 
 		 198 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  47.69 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  43.01 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  47.37 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  44.68 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  47.8 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  46.74 
 
 		 209 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  48.37 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  48.4 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  40.58 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  50 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  46.45 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  49.17 
 
 		 206 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  48.91 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  46.2 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2047  ribonuclease HII  45.21 
 
 		 198 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000947482  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  50.81 
 
 		 197 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 210 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  44.21 
 
 		 260 aa  154  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  42.25 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  50.53 
 
 		 190 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  45.5 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  44.57 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  45.59 
 
 		 217 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>