More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0721 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  55.54 
 
 		 630 aa  669    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  52.7 
 
 		 648 aa  667    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  52.7 
 
 		 648 aa  667    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 656 aa  1340    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  49.62 
 
 		 706 aa  596  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  39.97 
 
 		 655 aa  450  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  39.63 
 
 		 669 aa  435  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  38.3 
 
 		 726 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  37.99 
 
 		 725 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  38.15 
 
 		 726 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  38.15 
 
 		 745 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  35.88 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  34.31 
 
 		 681 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  36.48 
 
 		 754 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  36.29 
 
 		 742 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  35.9 
 
 		 700 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  34.79 
 
 		 733 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  35.94 
 
 		 687 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  36.79 
 
 		 725 aa  351  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  34.68 
 
 		 702 aa  347  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.65 
 
 		 686 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  34.59 
 
 		 694 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  35.38 
 
 		 702 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  36.02 
 
 		 686 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  34.87 
 
 		 689 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  34.59 
 
 		 689 aa  340  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  35.06 
 
 		 717 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  34.52 
 
 		 708 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2743  UvrD/REP helicase  35.2 
 
 		 688 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  32.66 
 
 		 714 aa  332  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 		 719 aa  329  9e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  34.19 
 
 		 720 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  34.13 
 
 		 750 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  35.65 
 
 		 712 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  34.11 
 
 		 687 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  34.79 
 
 		 686 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  34.84 
 
 		 685 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.3 
 
 		 719 aa  323  8e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05321  ATP-dependent DNA helicase II protein  32.38 
 
 		 710 aa  320  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  32.87 
 
 		 768 aa  319  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  33.03 
 
 		 707 aa  313  7.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  33.99 
 
 		 745 aa  312  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  32.94 
 
 		 746 aa  311  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.89 
 
 		 732 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 		 705 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  33.28 
 
 		 714 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4241  UvrD/REP helicase  32.29 
 
 		 716 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4129  UvrD/REP helicase  32.29 
 
 		 716 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.98 
 
 		 738 aa  303  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  32.08 
 
 		 738 aa  302  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.18 
 
 		 747 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  33.18 
 
 		 753 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.95 
 
 		 718 aa  301  2e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.18 
 
 		 751 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.18 
 
 		 751 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.18 
 
 		 751 aa  301  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  33.18 
 
 		 751 aa  301  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.13 
 
 		 747 aa  300  4e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.18 
 
 		 747 aa  301  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.98 
 
 		 753 aa  299  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  30.63 
 
 		 759 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  33.61 
 
 		 676 aa  299  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.83 
 
 		 753 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  31.87 
 
 		 738 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2469  UvrD/REP helicase  32.67 
 
 		 724 aa  297  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.43 
 
 		 725 aa  296  7e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  32.42 
 
 		 709 aa  296  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  32.42 
 
 		 709 aa  296  8e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  32.61 
 
 		 769 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.48 
 
 		 759 aa  295  1e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  31.2 
 
 		 779 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.88 
 
 		 754 aa  295  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.67 
 
 		 741 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.63 
 
 		 785 aa  294  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  34.07 
 
 		 731 aa  293  6e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  32.38 
 
 		 758 aa  293  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  30.29 
 
 		 789 aa  293  9e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  31.92 
 
 		 757 aa  292  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  32.53 
 
 		 762 aa  292  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.29 
 
 		 742 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.85 
 
 		 730 aa  291  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.85 
 
 		 730 aa  291  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  31.91 
 
 		 768 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  33.81 
 
 		 625 aa  290  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.18 
 
 		 786 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  30.51 
 
 		 751 aa  289  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  32.57 
 
 		 739 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  31.36 
 
 		 845 aa  288  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  33.39 
 
 		 735 aa  288  2e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.66 
 
 		 763 aa  288  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  33.07 
 
 		 749 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  31.37 
 
 		 706 aa  287  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  32.65 
 
 		 689 aa  287  4e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.84 
 
 		 794 aa  287  4e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.34 
 
 		 741 aa  287  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.85 
 
 		 694 aa  287  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  31.02 
 
 		 765 aa  287  5e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  31.78 
 
 		 773 aa  286  5.999999999999999e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  32.18 
 
 		 764 aa  286  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.08 
 
 		 729 aa  286  9e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>