97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4439 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  100 
 
 		 66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4533  sulfur carrier protein ThiS  95.45 
 
 		 66 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03868  sulfur carrier protein ThiS  93.94 
 
 		 66 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03821  hypothetical protein  93.94 
 
 		 66 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4225  sulfur carrier protein ThiS  93.94 
 
 		 66 aa  122  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4482  sulfur carrier protein ThiS  93.94 
 
 		 66 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4003  thiamine biosynthesis protein ThiS  93.94 
 
 		 66 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4034  sulfur carrier protein ThiS  93.94 
 
 		 66 aa  121  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5459  sulfur carrier protein ThiS  92.42 
 
 		 66 aa  119  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.179752 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4371  sulfur carrier protein ThiS  75.76 
 
 		 66 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4567  sulfur carrier protein ThiS  75.76 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000396469 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  72.73 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4491  sulfur carrier protein ThiS  71.21 
 
 		 66 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4493  sulfur carrier protein ThiS  72.73 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.439278  hitchhiker  0.00000334012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4404  thiamine biosynthesis protein ThiS  71.21 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0281  sulfur carrier protein ThiS  60.61 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0217  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0213  sulfur carrier protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3873  thiamine biosynthesis protein ThiS  57.58 
 
 		 66 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3718  thiamine biosynthesis protein ThiS  56.06 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.827217  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0044  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.107556  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0344  sulfur carrier protein ThiS  56.25 
 
 		 71 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0452  sulfur carrier protein ThiS  56.25 
 
 		 71 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000134216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2390  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233708  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  39.39 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2111  thiS protein  37.88 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.719096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0363  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.42 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  37.88 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  28.79 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.23 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.88 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2986  thiamine biosynthesis protein ThiS  63.89 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2396  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  32.84 
 
 		 327 aa  48.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00143  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2589  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  normal  0.0105127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1608  sulfur transfer protein  46.15 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.156932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.39 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3235  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320513  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  33.33 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3504  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.169395  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4741  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.243463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1830  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.99 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.6474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6572  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.88 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  24.24 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5331  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.883696  normal  0.241111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0433  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1604  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.82 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36595  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.74 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  27.27 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3189  sulfur carrier protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2397  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.86 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  28.36 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  30.3 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1185  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.029771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.21 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1633  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  33.33 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  25.76 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2400  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.84 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3147  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.054012  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1285  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.29 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2442  thiS protein, putative  34.38 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1937  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.841225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1785  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.85 
 
 		 65 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3292  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  30.3 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2094  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.900553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  28.79 
 
 		 374 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3474  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1884  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0146  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.07 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4884  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.82 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1554  thiamine biosynthesis protein ThiS  28.79 
 
 		 211 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.636206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  28.79 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  28.79 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 65 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4168  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.852753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  25.76 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>