More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3128 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  90.23 
 
 		 696 aa  1286    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  55.57 
 
 		 698 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  90.23 
 
 		 696 aa  1286    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  55.57 
 
 		 698 aa  790    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  53.69 
 
 		 702 aa  752    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  55.57 
 
 		 698 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  57.91 
 
 		 714 aa  816    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  100 
 
 		 695 aa  1424    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  44.49 
 
 		 743 aa  579  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  40.94 
 
 		 726 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  35.98 
 
 		 806 aa  450  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  35.4 
 
 		 696 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  34.32 
 
 		 702 aa  395  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  34.59 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 804 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  33.1 
 
 		 696 aa  379  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  34.64 
 
 		 653 aa  365  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  34.65 
 
 		 652 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  35.62 
 
 		 655 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 652 aa  352  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  34.55 
 
 		 665 aa  352  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  33.33 
 
 		 663 aa  351  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  33.43 
 
 		 666 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  35.78 
 
 		 665 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  35.78 
 
 		 665 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  35.78 
 
 		 665 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  33.43 
 
 		 666 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  33.43 
 
 		 666 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  33.43 
 
 		 666 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 740 aa  345  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  33.29 
 
 		 666 aa  345  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 658 aa  340  5e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  32.95 
 
 		 663 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  34.56 
 
 		 700 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  34.81 
 
 		 698 aa  327  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.98 
 
 		 656 aa  323  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 713 aa  321  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  32.21 
 
 		 656 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  31.21 
 
 		 704 aa  301  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  33.13 
 
 		 676 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 697 aa  293  7e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  32.34 
 
 		 650 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  32.34 
 
 		 650 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  32.34 
 
 		 650 aa  287  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  31.88 
 
 		 659 aa  287  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  32.19 
 
 		 650 aa  286  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  32.34 
 
 		 650 aa  286  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  31.56 
 
 		 663 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  31.56 
 
 		 663 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  31.56 
 
 		 663 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  31.56 
 
 		 663 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.56 
 
 		 663 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  31.56 
 
 		 663 aa  285  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  31.85 
 
 		 641 aa  284  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  29.99 
 
 		 680 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 799 aa  280  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 799 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 799 aa  277  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  33.39 
 
 		 572 aa  274  4.0000000000000004e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 715 aa  273  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  32.79 
 
 		 732 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  31.37 
 
 		 739 aa  266  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  29.26 
 
 		 656 aa  264  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  31.26 
 
 		 653 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 635 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 649 aa  259  9e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 681 aa  256  7e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 680 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 648 aa  251  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 662 aa  250  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 662 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 662 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 653 aa  246  9e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 649 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 649 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 661 aa  239  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 665 aa  238  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 657 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  30.57 
 
 		 640 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  30.27 
 
 		 746 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  30.32 
 
 		 744 aa  210  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  30.22 
 
 		 744 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  30.17 
 
 		 744 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  29.99 
 
 		 759 aa  204  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  28.03 
 
 		 746 aa  194  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 650 aa  193  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  28.16 
 
 		 746 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  27.76 
 
 		 746 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  28.03 
 
 		 746 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00550  iron-enterobactin outer membrane transporter  27.76 
 
 		 746 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000104738  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0633  outer membrane receptor FepA  27.76 
 
 		 746 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00539  hypothetical protein  27.76 
 
 		 746 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000136629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  27.89 
 
 		 746 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3043  TonB-dependent siderophore receptor  27.63 
 
 		 746 aa  190  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0305175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.92 
 
 		 742 aa  190  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  28.73 
 
 		 746 aa  188  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  28.07 
 
 		 757 aa  187  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  28.49 
 
 		 742 aa  186  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1116  outer membrane receptor FepA  27.38 
 
 		 750 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  27.77 
 
 		 749 aa  180  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>