More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3031 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  88.46 
 
 		 188 aa  340  7e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  89.5 
 
 		 184 aa  338  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  86.74 
 
 		 184 aa  333  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  72.22 
 
 		 189 aa  275  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  65.41 
 
 		 188 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  63.98 
 
 		 190 aa  249  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  65.57 
 
 		 187 aa  248  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  63.74 
 
 		 185 aa  234  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  63.74 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  62.09 
 
 		 188 aa  231  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  61.2 
 
 		 185 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  62.3 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  62.3 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  61.96 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  61.2 
 
 		 188 aa  224  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  61.41 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  54.01 
 
 		 187 aa  217  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  58.47 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  65.19 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  55.56 
 
 		 193 aa  201  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  56.91 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  50.79 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  53.41 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  54.86 
 
 		 191 aa  187  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  54.86 
 
 		 191 aa  187  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  53.41 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  52.84 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  51.4 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  51.08 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  50.28 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  46.24 
 
 		 186 aa  175  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 203 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  50.28 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  60.43 
 
 		 307 aa  167  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  60.43 
 
 		 307 aa  167  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  61.27 
 
 		 309 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  49.72 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 		 188 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  49.72 
 
 		 194 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  48.9 
 
 		 196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  48.59 
 
 		 189 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  56.34 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  47.49 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  49.19 
 
 		 197 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  46.88 
 
 		 192 aa  164  5e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  48.86 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  53.9 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  52.11 
 
 		 183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  52.11 
 
 		 183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  50.55 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  44.38 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  47.19 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  50.56 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  49.72 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  49.72 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  49.72 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  47.75 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  50.57 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  45.7 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  56.38 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  55.03 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  55.41 
 
 		 176 aa  158  6e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  50.27 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  46.96 
 
 		 313 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  53.06 
 
 		 309 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  47.22 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  47.46 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  56.03 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  56.03 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  56.21 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00849  putative DNA-invertase  92.5 
 
 		 91 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  51.35 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  52.87 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00855  hypothetical protein  92.5 
 
 		 93 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  45.88 
 
 		 224 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  46.81 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  48.15 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  48.15 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  48.15 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  48.85 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  50.6 
 
 		 305 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  55.56 
 
 		 190 aa  151  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  55.56 
 
 		 190 aa  151  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  55.56 
 
 		 190 aa  151  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  48.89 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  54.11 
 
 		 293 aa  151  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  48.3 
 
 		 192 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  48.3 
 
 		 191 aa  150  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  48.89 
 
 		 190 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  55.47 
 
 		 326 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  43.32 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  54.01 
 
 		 324 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  45.79 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  46.7 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  46.2 
 
 		 193 aa  148  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  46.2 
 
 		 193 aa  148  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  51.69 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  58.87 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  51.66 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>