More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1346 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  64.43 
 
 		 199 aa  237  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  64.77 
 
 		 198 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  65.64 
 
 		 199 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  54.4 
 
 		 199 aa  215  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  54.82 
 
 		 200 aa  204  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  49.21 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  52.82 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  54.4 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  49.75 
 
 		 200 aa  160  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  41.9 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  41.9 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  45.41 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  41.58 
 
 		 235 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  42.79 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  43.65 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  44.5 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  45.21 
 
 		 196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  36.36 
 
 		 259 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  40.1 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  38.32 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  34.95 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  39.49 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  34.65 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  40.2 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  37.02 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  35.05 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  38.27 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  37.63 
 
 		 832 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  33.8 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  35.27 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  30.27 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  34.13 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  31.1 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  38.74 
 
 		 825 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  35.48 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  33.49 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  36.9 
 
 		 229 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  33.16 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  31.58 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  32.06 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  28.37 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  36.32 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  35.48 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  32.14 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  35.2 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  33.82 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  35.57 
 
 		 819 aa  94.4  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  26.44 
 
 		 243 aa  92.8  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  33.33 
 
 		 201 aa  91.7  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  29.7 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  30.2 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  31.5 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  29.38 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  31.44 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  31.96 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.35 
 
 		 174 aa  89.7  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  33.33 
 
 		 827 aa  89.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  31.52 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  31.52 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  31.52 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  32.8 
 
 		 206 aa  89  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  30.98 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  29.07 
 
 		 234 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  33.65 
 
 		 204 aa  88.6  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.98 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  30.43 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  30.98 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  32.02 
 
 		 241 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  29.11 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  31.25 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  41.28 
 
 		 305 aa  86.3  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  30.65 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  30.3 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  28.95 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  33.67 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  31.75 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  29.11 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  29.72 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  30.23 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  30.19 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  29.72 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  29.41 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  32.62 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  28.65 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1828  cytochrome c oxidase subunit III  29.63 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  32.62 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  31.22 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  31.22 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  32.12 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  32.02 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  27.9 
 
 		 294 aa  81.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  34.67 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  33.87 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6212  cytochrome c oxidase, subunit III  31.96 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  33.87 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  33.87 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  35.62 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>