More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3043 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 323 aa  626  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  67.71 
 
 		 294 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  60.79 
 
 		 288 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  47.87 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  49.47 
 
 		 294 aa  215  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.35 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.66 
 
 		 289 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 		 310 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  29.75 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  28.95 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  30.24 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.14 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  23.08 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.25 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  30.36 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  27.97 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  31.58 
 
 		 292 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.82 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  31.6 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.82 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0729  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0409163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.88 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  31.83 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  29.08 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  31.14 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  31.49 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  31.49 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.61 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  30.54 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.25 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.37 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  29.49 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  25.86 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.27 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  31.14 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.51 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.86 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  25 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.138345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.96 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  30.22 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  29.82 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  30.22 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  29.48 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0742  hypothetical protein  28.72 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  30.93 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.2 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  30.47 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  30.71 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  24.2 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  30.04 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  30.04 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  25.19 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  30.04 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  30.04 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  26.42 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  21.71 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.62 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  22.05 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  22.43 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  21.53 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  22.43 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  22.43 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  22.43 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3614  integral membrane protein  27.57 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  26.3 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  32.42 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.61 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1515  hypothetical protein  26.02 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.910638  normal  0.799854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  30.14 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.28 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  22.02 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.43 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.87 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.41 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.67 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.28 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  23.28 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  27.72 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  26.69 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  23.28 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.28 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.28 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  22.93 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  23.28 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  21.41 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  25.35 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  31.97 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.18 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.44 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>