75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1207 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 160 aa  336  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  97.5 
 
 		 160 aa  329  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  63.64 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  56.49 
 
 		 164 aa  186  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  50.91 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  51.92 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  49.06 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  52.74 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  49.09 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  55.81 
 
 		 181 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  52.94 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  46.71 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  52.1 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  50 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  51.26 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  46.81 
 
 		 272 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  41.03 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  42.24 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  46 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  40.51 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  42.41 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  42.41 
 
 		 162 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  39.88 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  40.79 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  43.09 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  39.74 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  38.04 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  39.37 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  38 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  44.55 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  43.09 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  43.64 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  41.18 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  34.16 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  41.18 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  38.52 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  39.34 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  34.06 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  32.03 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  32.47 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  33.12 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  32.21 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  30.07 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.43 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  28.96 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  29.41 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  30.43 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  35.71 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  30.5 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  28.32 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  25.29 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  28.23 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  25.32 
 
 		 534 aa  52  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  31.13 
 
 		 287 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  30.1 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  26.9 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  28.8 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.36 
 
 		 1171 aa  47.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  31.87 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  24.78 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2366  blue (type1) copper domain-containing protein  24.78 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0881653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  25.41 
 
 		 722 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  24 
 
 		 669 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  26.45 
 
 		 153 aa  44.7  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  25.22 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  62.96 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  27.18 
 
 		 505 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  22.88 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  23.03 
 
 		 673 aa  41.6  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  27.19 
 
 		 241 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.4 
 
 		 1265 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  27.68 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0747  glucose-6-phosphate isomerase  35.38 
 
 		 529 aa  40.8  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  0.0359035 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>