More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2579 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  100 
 
 
562 aa  1154    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  44.39 
 
 
565 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  41.52 
 
 
567 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  43.01 
 
 
566 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 
570 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  39.46 
 
 
555 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  43.81 
 
 
572 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  41.28 
 
 
558 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  40.04 
 
 
565 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  39.27 
 
 
577 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  38.3 
 
 
579 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  37.89 
 
 
573 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  37.61 
 
 
579 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 
583 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  37.09 
 
 
579 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  37.44 
 
 
579 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  37.09 
 
 
579 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  37.09 
 
 
579 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  37.44 
 
 
579 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.84 
 
 
557 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  38.48 
 
 
558 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 
579 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  36.92 
 
 
583 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 
579 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  37.21 
 
 
559 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  37.94 
 
 
580 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  39.08 
 
 
574 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  37.37 
 
 
586 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  37.59 
 
 
554 aa  363  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  36.06 
 
 
573 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  35.42 
 
 
556 aa  353  7e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  39.65 
 
 
560 aa  352  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  37.95 
 
 
556 aa  351  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  36.29 
 
 
601 aa  346  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 
558 aa  345  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  36.83 
 
 
554 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  36.16 
 
 
572 aa  344  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  34.64 
 
 
565 aa  340  5e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  34.81 
 
 
565 aa  340  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  36.72 
 
 
599 aa  340  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 
553 aa  339  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  37.48 
 
 
561 aa  334  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 
553 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  35.89 
 
 
567 aa  333  4e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  34.47 
 
 
559 aa  333  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  34.47 
 
 
559 aa  333  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  34.86 
 
 
587 aa  333  7.000000000000001e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  35.17 
 
 
552 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  36.01 
 
 
557 aa  329  7e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  38.78 
 
 
553 aa  329  9e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  36.35 
 
 
588 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.97 
 
 
555 aa  326  7e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  34.41 
 
 
562 aa  326  8.000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  34.12 
 
 
605 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  36.51 
 
 
569 aa  323  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 
552 aa  323  4e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  35.88 
 
 
560 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  34.33 
 
 
589 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  36.07 
 
 
575 aa  320  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  35.23 
 
 
588 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1995  DNA repair protein RecN  34.57 
 
 
586 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  35.18 
 
 
569 aa  320  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2022  DNA repair protein RecN  34.45 
 
 
586 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.499212  normal  0.676493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  35.13 
 
 
557 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  35.25 
 
 
568 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1904  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 
585 aa  318  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641483  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 
551 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  33.93 
 
 
555 aa  316  6e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  34.48 
 
 
551 aa  316  7e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.89 
 
 
555 aa  316  9e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1913  DNA repair protein RecN  33.16 
 
 
585 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0988612  normal  0.166083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  35.07 
 
 
568 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  34.52 
 
 
549 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  34.52 
 
 
549 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  34.52 
 
 
549 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  34.52 
 
 
549 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  34.52 
 
 
549 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  34.52 
 
 
549 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  36.07 
 
 
588 aa  313  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  35.15 
 
 
580 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  34.34 
 
 
549 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  34.59 
 
 
557 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  34.71 
 
 
569 aa  310  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 
561 aa  310  5e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  34.52 
 
 
549 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 
556 aa  307  3e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  34.58 
 
 
549 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 
552 aa  306  6e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 
558 aa  306  7e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  34.22 
 
 
549 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 
558 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 
559 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  33.03 
 
 
552 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.03 
 
 
552 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  35.06 
 
 
558 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  34.34 
 
 
549 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  34.34 
 
 
549 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  34.34 
 
 
549 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  33.69 
 
 
552 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  33.69 
 
 
552 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>