More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2087 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2795  ATP synthase F0, A subunit  64.53 
 
 		 234 aa  290  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.073854  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  63.73 
 
 		 233 aa  270  9e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  63.24 
 
 		 233 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  53.65 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2254  ATP synthase F0, A subunit  54.73 
 
 		 234 aa  231  9e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0384265  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  52.48 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  51.98 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  52.97 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  51.98 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  51.49 
 
 		 229 aa  208  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  51.49 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  51.49 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  52.48 
 
 		 229 aa  204  9e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1605  ATP synthase F0, A subunit  47.68 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  49.51 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0630  ATP synthase F0, A subunit  50.22 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  48.77 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  39.71 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1338  F0F1 ATP synthase subunit A  46.5 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.757914  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1219  F0F1 ATP synthase subunit A  46.5 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0526  F0F1 ATP synthase subunit A  45.5 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1208  F0F1 ATP synthase subunit A  43.3 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  40.38 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0771  F0F1 ATP synthase subunit A  44.1 
 
 		 226 aa  151  7e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00573947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0790  F0F1 ATP synthase subunit A  45.65 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1134  ATP synthase F0, A subunit  44.68 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  45.65 
 
 		 258 aa  142  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0159  F0F1 ATP synthase subunit A  39.81 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0542441  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0723  F0F1 ATP synthase subunit A  39.73 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1339  F0F1 ATP synthase subunit A  40.98 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0989022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  37.8 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4171  ATP synthase F0, A subunit  38.14 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.042637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2388  ATP synthase F0, A subunit  37.5 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4100  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000342736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3933  F0F1 ATP synthase subunit A  33.18 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.056458  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2143  ATP synthase F0, A subunit  34.43 
 
 		 257 aa  121  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17870  ATP synthase F0, A subunit  36.27 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0046  F0F1 ATP synthase subunit A  30.77 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959429  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0848  F0F1 ATP synthase subunit A  34.33 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2193  F0F1 ATP synthase subunit A  35.24 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2331  F0F1 ATP synthase subunit A  34.72 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0077  ATP synthase F0, A subunit  33.95 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0064  F0F1 ATP synthase subunit A  33.88 
 
 		 345 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  37.11 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2851  ATP synthase F0, A subunit  33.99 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0522079 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0483  F0F1 ATP synthase subunit A  34.76 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1882  F0F1 ATP synthase subunit A  28.83 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195651  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0135  ATP synthase F0, A subunit  40 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.276853  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 261 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  35.07 
 
 		 282 aa  108  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 261 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  35.05 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  34.67 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  34.45 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1436  ATP synthase A chain (ATPase protein 6)  35.08 
 
 		 194 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.595185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1299  ATP synthase F0, A subunit  39.46 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.14365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1053  F0F1 ATP synthase subunit A  33.65 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0801  ATP synthase F0, A subunit  34.36 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0532  ATP synthase F0, A subunit  31.62 
 
 		 314 aa  105  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000978517  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  37 
 
 		 251 aa  104  8e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3156  ATP synthase F0, A subunit  33.94 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2672  F0F1 ATP synthase subunit A  33.17 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0439  F0F1 ATP synthase subunit A  32.7 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0846415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  28.96 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2699  F0F1 ATP synthase subunit A  31.69 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0558  ATP synthase F0, A subunit  31.22 
 
 		 314 aa  102  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000487089  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_497  ATP synthase F0, A subunit  31.49 
 
 		 314 aa  102  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  33.92 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  33.03 
 
 		 251 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5556  F0F1 ATP synthase subunit A  29.27 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0415006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  36.18 
 
 		 248 aa  101  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04781  F0F1 ATP synthase subunit A  34.76 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1067  F0F1 ATP synthase subunit A  35 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.560179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3388  F0F1 ATP synthase subunit A  35.12 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  35.47 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2715  F0F1 ATP synthase subunit A  35.12 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2502  F0F1 ATP synthase subunit A  32.78 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2993  F0F1 ATP synthase subunit A  32.31 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  34.63 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1165  F0F1 ATP synthase subunit A  34 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.273852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0948  F0F1 ATP synthase subunit A  32.02 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0817957  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  31.6 
 
 		 251 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  30.74 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  33.33 
 
 		 260 aa  98.6  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2098  F0F1 ATP synthase subunit A  33.76 
 
 		 341 aa  98.6  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  31.82 
 
 		 267 aa  98.2  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2624  F0F1 ATP synthase subunit A  34.65 
 
 		 252 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.830834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  35.5 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0069  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 		 284 aa  97.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0331  F0F1 ATP synthase subunit A  35.1 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0266  F0F1 ATP synthase subunit A  31.51 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1657  F0F1 ATP synthase subunit A  30.05 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3333  ATP synthase F0 subunit A  35.12 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2709  F0F1 ATP synthase subunit A  32.08 
 
 		 342 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.018476  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  34.47 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1487  F0F1 ATP synthase subunit A  34.45 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.327083  normal  0.531066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>