106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1790 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1790  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 307 aa  634    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1696  radical SAM domain-containing protein  60.61 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1488  Radical SAM domain protein  51.5 
 
 		 323 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2282  radical SAM domain-containing protein  52.45 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1956  Radical SAM domain protein  50.17 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1225  Radical SAM domain protein  45.74 
 
 		 301 aa  293  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1072  radical SAM domain-containing protein  48.98 
 
 		 306 aa  288  8e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1372  radical SAM domain-containing protein  51.36 
 
 		 298 aa  285  7e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1076  Radical SAM domain protein  46.18 
 
 		 327 aa  281  7.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3220  radical SAM family protein  49 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0910246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4313  radical SAM domain-containing protein  51.28 
 
 		 305 aa  280  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4174  radical SAM domain-containing protein  52.01 
 
 		 305 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000899263  hitchhiker  0.0000122101 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1667  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1745  Radical SAM domain protein  46.32 
 
 		 303 aa  272  6e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0609211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1859  radical SAM domain-containing protein  45.04 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.54951  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07611  pyruvate formate lyase activating enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15630)  45.83 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00159546  normal  0.16163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1772  radical SAM family protein  43.97 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.138508  normal  0.113699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1274  radical SAM domain-containing protein  44.33 
 
 		 319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.330948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0368  radical SAM family protein  46.32 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000743683  normal  0.888767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3427  radical SAM domain-containing protein  42.09 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0003  radical SAM domain-containing protein  42.7 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0003  radical SAM domain-containing protein  42.7 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1899  Radical SAM domain protein  45.17 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.735258  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2121  radical SAM domain-containing protein  45.87 
 
 		 326 aa  225  9e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152404  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0616  radical SAM domain-containing protein  46.42 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2082  radical SAM  40.07 
 
 		 308 aa  221  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1063  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1251  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269935  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2526  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.252975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0110  Radical SAM domain protein  38.66 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.389889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2309  Radical SAM domain protein  43.63 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1289  radical SAM domain-containing protein  39.85 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1368  radical SAM domain-containing protein  43.45 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0299345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1149  radical SAM domain protein  43.68 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000033704  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1179  radical SAM domain-containing protein  40.42 
 
 		 334 aa  209  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0438654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1947  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0815  radical SAM domain-containing protein  39.93 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0883393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0838  radical SAM domain-containing protein  39.93 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0661  Radical SAM domain protein  37.28 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1949  radical SAM domain-containing protein  36.08 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1152  Radical SAM domain protein  43.21 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.429756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1143  radical SAM domain-containing protein  35.9 
 
 		 287 aa  198  7e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0526  Radical SAM domain protein  41.49 
 
 		 344 aa  197  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0095894  unclonable  0.0000000400012 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1701  radical SAM domain-containing protein  37.55 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  35.27 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206983 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09130  pyruvate formate lyase activating protein-like uncharacterized Fe-S protein  37.23 
 
 		 326 aa  172  9e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0210847  normal  0.81477 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2506  radical SAM domain-containing protein  34.66 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000358558  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0925  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0826  radical SAM domain-containing protein  36.89 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0283607 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1370  radical SAM domain-containing protein  37.3 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1947  radical SAM domain-containing protein  36.4 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3602  formate acetyltransferase activating enzyme  32.48 
 
 		 345 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.795374  normal  0.163348 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0987  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 		 371 aa  136  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0881  radical SAM domain-containing protein  33.72 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.607875  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  30.1 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0983  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0354  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.898506 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0338  radical SAM domain-containing protein  32.8 
 
 		 348 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0270  radical SAM domain-containing protein  28.73 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  28.44 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2681  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480916  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1455  Radical SAM domain protein  24.81 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2402  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1066  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.925022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01540  Radical SAM domain protein  23.41 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02500  Radical SAM domain protein  23.41 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000194797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2294  radical SAM family protein  28.9 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0731  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00683582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0041  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 		 362 aa  49.3  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.821324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0219  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 337 aa  48.9  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0211251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0073  pyruvate formate lyase-activating enzyme, putative  26.77 
 
 		 365 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1815  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2431  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4120  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 372 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.424935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0759  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1963  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0105086  decreased coverage  0.00565461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2555  Radical SAM domain protein  26.26 
 
 		 366 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466932  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1585  hypothetical protein  26.63 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0308  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  28.72 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000547663  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1052  radical SAM family protein  24.23 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0963674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1460  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0728  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0574  radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0103  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1648  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 		 363 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2217  Radical SAM domain protein  27.6 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0360  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 282 aa  43.9  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0777899  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1712  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0396  radical SAM family protein  29.55 
 
 		 358 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1524  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 337 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1694  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.953973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1995  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 405 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0022  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0542  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 384 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0194035 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1064  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 364 aa  43.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1240  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1215  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1625  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 363 aa  43.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>