262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0576 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  41.63 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  36.45 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  36.41 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  36.41 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  35.08 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  37.25 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  38.66 
 
 		 228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  35.09 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  33.68 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  35.45 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  35.11 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  33.8 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  33.8 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  32.69 
 
 		 234 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  37.22 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  33.8 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  35.2 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  36.63 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  34.11 
 
 		 221 aa  101  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  31.05 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  36.59 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  32.26 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  31.55 
 
 		 222 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  31.9 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  32.82 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  33.51 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  35.47 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  35.75 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  35.75 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  32.8 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3581  flagellar hook capping protein  32.53 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  32.57 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  35.23 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0631  flagellar hook capping protein  38.1 
 
 		 220 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  32.26 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  34.02 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  34.57 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  34.57 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  32.28 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  34.55 
 
 		 278 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  34.02 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  34.81 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  34.02 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  33.94 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  34.02 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  33.73 
 
 		 245 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  34.02 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  34.02 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  34.62 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  34.81 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  34.02 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1904  flagellar basal body rod modification protein  30.22 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  33.71 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  33.94 
 
 		 280 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  33.16 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  33.94 
 
 		 280 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  32.47 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  33.94 
 
 		 280 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  34.3 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  34.19 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1976  flagellar basal body rod modification protein  32.89 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  31.28 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  34.19 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0567  flagellar hook capping protein  32.43 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  33.77 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0518  flagellar hook capping protein  32.18 
 
 		 293 aa  90.9  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  34.19 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  34.19 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  33.33 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  33.76 
 
 		 251 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  35.38 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1774  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  34.34 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  31.61 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2933  flagellar basal body rod modification protein  34.73 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.766915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3068  flagellar basal body rod modification protein  34.73 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06155  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000566097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  33.14 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01011  flagellar basal body rod modification protein  30.81 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.695232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  36.18 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3716  flagellar hook capping protein  32.64 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  31.52 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1589  flagellar basal body rod modification protein  31.28 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  33.69 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  30.05 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  31.94 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  33.33 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  30.41 
 
 		 222 aa  85.5  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2533  flagellar hook capping protein  30.54 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  32.37 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  34.57 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0895  flagellar hook capping protein  30.3 
 
 		 222 aa  85.1  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>