247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0305 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 342 aa  694    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  48.41 
 
 		 354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1195  heat-inducible transcription repressor HrcA  46.8 
 
 		 355 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.300554 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2882  heat-inducible transcription repressor HrcA  47.81 
 
 		 338 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.483845  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2164  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.86 
 
 		 355 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.705839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.12 
 
 		 343 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.12 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  40.18 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.9 
 
 		 344 aa  242  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.58 
 
 		 343 aa  235  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.15 
 
 		 343 aa  235  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.24 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.18 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.76 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.62 
 
 		 345 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.58 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  34.9 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  34.71 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  34.41 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.02 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  38.44 
 
 		 357 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.73 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.12 
 
 		 344 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.86 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.53 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.43 
 
 		 347 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  33.92 
 
 		 342 aa  205  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  34.71 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.73 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  35.04 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.9 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.9 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01183  heat-inducible transcription repressor  33.73 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.180018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  35.71 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0970  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.38 
 
 		 350 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.477518  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  33.24 
 
 		 342 aa  202  7e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0166  heat-inducible transcription repressor  35.65 
 
 		 358 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.714476  normal  0.458775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  33.72 
 
 		 352 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.23 
 
 		 351 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  33.93 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2503  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 339 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.54 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.24 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2886  heat-inducible transcription repressor  33.43 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3333  heat-inducible transcription repressor  34.67 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  35.1 
 
 		 337 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  30.47 
 
 		 339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.63 
 
 		 351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  34.21 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.16 
 
 		 353 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  30.47 
 
 		 339 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.16 
 
 		 353 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.76 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0639  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0663  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2032  heat-inducible transcription repressor  36.58 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  34.99 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0261  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0745  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.211832  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1874  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.48 
 
 		 357 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00580637  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0715  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2480  heat-inducible transcription repressor  32.86 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  34.23 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  33.63 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1598  heat-inducible transcription repressor  35.52 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.951274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2639  heat-inducible transcription repressor  34.23 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  36.47 
 
 		 355 aa  192  9e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0194  heat-inducible transcription repressor  34.99 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.636083  normal  0.88181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.86 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1487  heat-inducible transcription repressor  32.94 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  34.22 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2649  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.414753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0333  heat-inducible transcription repressor  35.57 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.5 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4252  heat-inducible transcription repressor  35.07 
 
 		 367 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  32.15 
 
 		 336 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1772  heat-inducible transcription repressor  32.45 
 
 		 336 aa  190  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.85 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  31.36 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0426  heat-inducible transcription repressor  35.28 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0152  heat-inducible transcription repressor  34.69 
 
 		 362 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  32.76 
 
 		 348 aa  189  8e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4017  heat-inducible transcription repressor  34.1 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0394  heat-inducible transcription repressor  34.99 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  33.33 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.07 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4761  heat-inducible transcription repressor  34.2 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  32.56 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.04 
 
 		 343 aa  186  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>