218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3107 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  100 
 
 
480 aa  970    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  25.16 
 
 
514 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1085  copper amine oxidase domain protein  28.21 
 
 
465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0168061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  56.31 
 
 
175 aa  123  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  57 
 
 
452 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  32.92 
 
 
487 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  30.14 
 
 
718 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  29.15 
 
 
833 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  52.04 
 
 
216 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.66 
 
 
383 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  43.31 
 
 
478 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  49 
 
 
483 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  45.63 
 
 
450 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47 
 
 
907 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  51.02 
 
 
113 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  45.71 
 
 
495 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  31.43 
 
 
1327 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  27.46 
 
 
553 aa  103  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  46.15 
 
 
259 aa  103  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.97 
 
 
420 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  53.06 
 
 
298 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  30.19 
 
 
486 aa  99.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  30.03 
 
 
1138 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1139  hypothetical protein  27.46 
 
 
553 aa  98.2  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0757324  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  26.25 
 
 
913 aa  97.8  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  30.1 
 
 
1426 aa  97.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  28.99 
 
 
652 aa  97.1  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  35.58 
 
 
521 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  48.86 
 
 
948 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  27.98 
 
 
929 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  51.65 
 
 
732 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1841  hypothetical protein  26.71 
 
 
534 aa  94.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.475393  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  27.91 
 
 
625 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  28.52 
 
 
625 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  35.54 
 
 
214 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  27.24 
 
 
605 aa  92.4  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  33 
 
 
756 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  27.18 
 
 
603 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  29.56 
 
 
402 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  26.27 
 
 
642 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0303  hypothetical protein  26.96 
 
 
644 aa  90.5  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.139753 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  46.67 
 
 
535 aa  90.1  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  29.59 
 
 
1118 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  43.56 
 
 
451 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  33.68 
 
 
986 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  41.9 
 
 
298 aa  89.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  47.73 
 
 
276 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  29.38 
 
 
1421 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  47.25 
 
 
143 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  38.73 
 
 
541 aa  86.7  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  45 
 
 
456 aa  86.7  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  26.01 
 
 
921 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  32.06 
 
 
418 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  42 
 
 
263 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  24.69 
 
 
660 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  42.42 
 
 
650 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  24.46 
 
 
952 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  30.12 
 
 
1164 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  40.68 
 
 
346 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  37.04 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  40.17 
 
 
267 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  40.17 
 
 
266 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  44.79 
 
 
547 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1858  copper amine oxidase domain protein  33.61 
 
 
229 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.164538 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  37.29 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  40.37 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  35.06 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  28.37 
 
 
559 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  28.37 
 
 
559 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  28.37 
 
 
563 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  28.37 
 
 
563 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  23.89 
 
 
686 aa  80.5  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  28.37 
 
 
563 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  36.92 
 
 
289 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  36.75 
 
 
336 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  39.32 
 
 
262 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  28.12 
 
 
563 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  36.75 
 
 
336 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  36.7 
 
 
553 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  38.26 
 
 
781 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  35.71 
 
 
763 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  42.16 
 
 
529 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  41.53 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  37.63 
 
 
540 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  32.79 
 
 
501 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  34.95 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  38.14 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  36.97 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  26.61 
 
 
1174 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  36.36 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  43.53 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  41.76 
 
 
481 aa  74.3  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  37.89 
 
 
1305 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.04 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  31.36 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  35.24 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  43.53 
 
 
950 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  33.14 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.76 
 
 
657 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  40 
 
 
176 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>