More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0962 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  100 
 
 
242 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
244 aa  131  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  37.28 
 
 
276 aa  99.4  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  29.64 
 
 
318 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  33.33 
 
 
292 aa  97.8  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  30.38 
 
 
244 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  31.84 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  39 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  36.88 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  29.28 
 
 
243 aa  85.9  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  29.44 
 
 
237 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  29.44 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  29.44 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  29.44 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  34.01 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  29.38 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  43.62 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  30.32 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  30.27 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  30.27 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  39.8 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
289 aa  79.3  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  29.73 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  28.29 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  28.29 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  38 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  35.85 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  27.84 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  37.24 
 
 
249 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  29.44 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  27.85 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  30.39 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  28.41 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  26.89 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  33.54 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  32.94 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  27.14 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  29.22 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  29.86 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  29.26 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
293 aa  65.1  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  40.4 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.61 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.25 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  32.85 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.11 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  36.96 
 
 
197 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  30.28 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
289 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
283 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
519 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0777  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
236 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.621905  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
527 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
235 aa  62  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  32.61 
 
 
237 aa  62  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  31.61 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  30.87 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  31.33 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.56 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  31.01 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.92 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  38.24 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
265 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2218  Methyltransferase type 11  30.12 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.13 
 
 
851 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.13 
 
 
851 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.13 
 
 
851 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  31.13 
 
 
851 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.53 
 
 
277 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  31.65 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.13 
 
 
851 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  29.93 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
531 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  28.73 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1022  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
273 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>