More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3162 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3162  hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 		 572 aa  1167    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4059  hydantoinase/oxoprolinase  56.28 
 
 		 566 aa  658    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0990  hydantoinase/oxoprolinase  43.85 
 
 		 557 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.454811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0836  Hydantoinase/oxoprolinase  42.42 
 
 		 583 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0997414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1002  hydantoinase/oxoprolinase  41.79 
 
 		 550 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2282  hydantoinase/oxoprolinase family protein  40.4 
 
 		 550 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0779  Hydantoinase/oxoprolinase  40.73 
 
 		 553 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0222  Hydantoinase/oxoprolinase  39.68 
 
 		 557 aa  399  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134992 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22450  N-methylhydantoinase (ATP-hydrolyzing)  37.35 
 
 		 579 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1404  hydantoinase/oxoprolinase  36.92 
 
 		 560 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2933  hydantoinase/oxoprolinase  34.39 
 
 		 570 aa  345  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0177705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1032  Hydantoinase/oxoprolinase  35.93 
 
 		 546 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1886  hydantoinase/oxoprolinase  36.3 
 
 		 560 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2126  Hydantoinase/oxoprolinase  34.71 
 
 		 556 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.031039  normal  0.0613561 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0975  hydantoinase/oxoprolinase  32.8 
 
 		 559 aa  294  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0999  Hydantoinase/oxoprolinase  33.51 
 
 		 564 aa  280  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2142  Hydantoinase/oxoprolinase  33.57 
 
 		 693 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2734  Hydantoinase/oxoprolinase  33.76 
 
 		 559 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3586  Hydantoinase/oxoprolinase  30.42 
 
 		 519 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0167077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1963  hydantoinase/oxoprolinase  28.87 
 
 		 516 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1967  hydantoinase/oxoprolinase  32.62 
 
 		 639 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0930  hydantoinase/oxoprolinase  28.57 
 
 		 481 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00360521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3269  hydantoinase/oxoprolinase  33.63 
 
 		 667 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0187  Hydantoinase/oxoprolinase  30.15 
 
 		 553 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1734  Hydantoinase/oxoprolinase  32.22 
 
 		 658 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2805  hydantoinase/oxoprolinase  32.93 
 
 		 668 aa  154  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0899  hydantoinase/oxoprolinase  29.81 
 
 		 643 aa  153  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.742994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1067  hydantoinase  31.06 
 
 		 671 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2491  hydantoinase  30.77 
 
 		 701 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0141  hydantoinase  31.31 
 
 		 644 aa  150  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.456007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2490  hydantoinase  31.89 
 
 		 636 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.48 
 
 		 657 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0092  hydantoinase/oxoprolinase family protein  30.56 
 
 		 575 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1134  hydantoinase/oxoprolinase  29 
 
 		 645 aa  145  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.187357  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1068  hydantoinase  31.79 
 
 		 642 aa  143  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0900  hydantoinase/oxoprolinase  30.77 
 
 		 641 aa  143  8e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.409671  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0817  hydantoinase/oxoprolinase  30.34 
 
 		 638 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.391568  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3064  Hydantoinase/oxoprolinase  28.34 
 
 		 526 aa  141  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  26.56 
 
 		 660 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1547  hydantoinase/oxoprolinase  25.22 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5378  hydantoinase  30.48 
 
 		 517 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0427  hydantoinase/oxoprolinase  26.89 
 
 		 519 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0645976  normal  0.347806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.03 
 
 		 676 aa  137  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0865  Hydantoinase/oxoprolinase  27.37 
 
 		 518 aa  136  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3293  hydantoinase/oxoprolinase  30.36 
 
 		 675 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.220696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3607  hypothetical protein  30.36 
 
 		 675 aa  135  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2141  Hydantoinase/oxoprolinase  27.94 
 
 		 519 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0652  Hydantoinase/oxoprolinase  29.87 
 
 		 516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0481682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1851  hydantoinase/oxoprolinase  25.75 
 
 		 518 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51976  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  25.84 
 
 		 687 aa  134  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  28.43 
 
 		 686 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.09 
 
 		 680 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1825  hydantoinase/oxoprolinase  25.75 
 
 		 523 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.31 
 
 		 690 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.87 
 
 		 680 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2018  Hydantoinase/oxoprolinase  27.29 
 
 		 707 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.48 
 
 		 690 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  26.57 
 
 		 706 aa  127  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.44 
 
 		 683 aa  127  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.35 
 
 		 684 aa  127  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0388506 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0803  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.78 
 
 		 684 aa  127  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.71 
 
 		 684 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.72 
 
 		 674 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.17 
 
 		 702 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.74 
 
 		 765 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2933  hydantoinase/oxoprolinase  30 
 
 		 570 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.68 
 
 		 707 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.73 
 
 		 682 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  28.51 
 
 		 681 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.9 
 
 		 691 aa  124  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.41 
 
 		 692 aa  124  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.68 
 
 		 681 aa  124  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1727  Hydantoinase/oxoprolinase  27.87 
 
 		 522 aa  123  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.666608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  26.24 
 
 		 679 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.39 
 
 		 674 aa  123  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.57 
 
 		 706 aa  123  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4110  Hydantoinase/oxoprolinase  26.36 
 
 		 522 aa  122  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.571056  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.56 
 
 		 676 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 994 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0124  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.74 
 
 		 690 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.256267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0422  hydantoinase/oxoprolinase  30.42 
 
 		 715 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0161  Hydantoinase/oxoprolinase  30.42 
 
 		 715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22890  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  27.2 
 
 		 515 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.14 
 
 		 681 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2226  5-oxoprolinase  28.34 
 
 		 680 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460045  normal  0.133433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3384  Hydantoinase/oxoprolinase  29.88 
 
 		 735 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637442  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.25 
 
 		 682 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4112  hydantoinase/oxoprolinase  24.73 
 
 		 538 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  24.64 
 
 		 676 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.57 
 
 		 694 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2416  putative hydantoinase A  25.49 
 
 		 517 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3366  N-methylhydantoinase A, beta-subunit (ATP- hydrolyzing)  30.53 
 
 		 507 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.712496  normal  0.127548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.67 
 
 		 690 aa  117  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.94 
 
 		 706 aa  117  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.74 
 
 		 679 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.9 
 
 		 692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.69 
 
 		 692 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  27.39 
 
 		 687 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4581  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  26.08 
 
 		 690 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1995  Hydantoinase/oxoprolinase  26.86 
 
 		 522 aa  114  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>