More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2575 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
740 aa  1528    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  33.5 
 
 
746 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.18 
 
 
696 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  38.3 
 
 
864 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  38.6 
 
 
1805 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  36.52 
 
 
741 aa  154  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  34.69 
 
 
903 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  30.82 
 
 
701 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  31.16 
 
 
701 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  37.7 
 
 
1119 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  35.29 
 
 
358 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  39.11 
 
 
859 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 
734 aa  147  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  38.2 
 
 
911 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  34.58 
 
 
364 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  38.67 
 
 
858 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  29.74 
 
 
482 aa  144  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  42.22 
 
 
645 aa  140  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  41.67 
 
 
670 aa  139  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.78 
 
 
797 aa  137  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  34.98 
 
 
860 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  29.52 
 
 
696 aa  137  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.86 
 
 
737 aa  137  7.000000000000001e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.4 
 
 
672 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.26 
 
 
656 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  35.14 
 
 
614 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.21 
 
 
861 aa  134  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  37.33 
 
 
636 aa  134  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  29.33 
 
 
726 aa  133  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  31.5 
 
 
641 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  36.12 
 
 
665 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  30.13 
 
 
712 aa  132  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 
738 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 
702 aa  130  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  33.2 
 
 
744 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  30.82 
 
 
1130 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  36.84 
 
 
794 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.98 
 
 
657 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.73 
 
 
758 aa  128  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 
1133 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
701 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.38 
 
 
758 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.71 
 
 
658 aa  126  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.75 
 
 
723 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  35.62 
 
 
650 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.5 
 
 
656 aa  126  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  34.13 
 
 
404 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  32.08 
 
 
479 aa  125  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  33.33 
 
 
936 aa  124  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  39.29 
 
 
641 aa  124  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.76 
 
 
754 aa  124  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  37.1 
 
 
1020 aa  124  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  40.61 
 
 
585 aa  124  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  27.89 
 
 
483 aa  124  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  30.49 
 
 
758 aa  123  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.05 
 
 
694 aa  122  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  30.6 
 
 
483 aa  122  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 
723 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  38.62 
 
 
284 aa  122  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  38.5 
 
 
523 aa  121  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  36.53 
 
 
667 aa  120  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  33.81 
 
 
638 aa  120  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  36.98 
 
 
1093 aa  120  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 
756 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  33.03 
 
 
725 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.43 
 
 
611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  28.15 
 
 
724 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  32.95 
 
 
752 aa  118  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  30.16 
 
 
758 aa  117  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  36.24 
 
 
593 aa  117  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.19 
 
 
764 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.2 
 
 
753 aa  117  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.99 
 
 
483 aa  116  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  32.23 
 
 
760 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  33.97 
 
 
717 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 
713 aa  114  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  33.33 
 
 
431 aa  114  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  37.36 
 
 
735 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  31.2 
 
 
446 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  33.33 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.16 
 
 
701 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.33 
 
 
703 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  31.2 
 
 
463 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.95 
 
 
725 aa  112  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
1473 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  39.22 
 
 
564 aa  111  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
1473 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
1473 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  37.91 
 
 
469 aa  111  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  34.48 
 
 
464 aa  110  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 
759 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 
348 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  35 
 
 
632 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  29.89 
 
 
462 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  30.87 
 
 
348 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  32.49 
 
 
526 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  36.32 
 
 
607 aa  108  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  37.37 
 
 
518 aa  108  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 
439 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.69 
 
 
500 aa  107  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>