More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2309 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  100 
 
 		 82 aa  167  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  62.03 
 
 		 81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  63.29 
 
 		 81 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  58.23 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  63.29 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 86 aa  105  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  62.03 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  62.03 
 
 		 197 aa  98.6  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  62.03 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  62.03 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  56.96 
 
 		 96 aa  98.2  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 87 aa  98.2  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_002978  WD0798  30S ribosomal protein S16  63.29 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 95 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 92 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  55.7 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 86 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 86 aa  94.7  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 81 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 192 aa  94  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  56.79 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 154 aa  93.6  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 96 aa  93.6  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 186 aa  92  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 81 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 201 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  54.43 
 
 		 85 aa  90.9  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 91 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 81 aa  90.1  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 81 aa  90.1  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 79 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 93 aa  90.1  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 81 aa  90.1  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  51.81 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 87 aa  89.4  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 188 aa  89  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  58.57 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 204 aa  89.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 134 aa  88.2  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3276  30S ribosomal protein S16  52.38 
 
 		 113 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 191 aa  88.6  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 88 aa  87.8  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 120 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  51.81 
 
 		 119 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 83 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 183 aa  87.4  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0069  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0915038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>