60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2069 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  48.68 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  42.15 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  42.92 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  41.59 
 
 		 244 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  37.24 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  41.82 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  40.66 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  40.61 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  40.71 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  36.28 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  36.91 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  38.05 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  35.95 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  36.36 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  40.51 
 
 		 964 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  38.3 
 
 		 972 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34.39 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  34.04 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  35.43 
 
 		 240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  37.66 
 
 		 244 aa  128  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  35.53 
 
 		 977 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  35.59 
 
 		 247 aa  121  8e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  34.98 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  35.78 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  37.97 
 
 		 998 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  29.63 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  33.52 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  37.12 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  39.11 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  31.4 
 
 		 736 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  27.98 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  33.19 
 
 		 891 aa  94.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  29.27 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  27.73 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  31.22 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  26.87 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  29.66 
 
 		 748 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 260 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 261 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 		 261 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  29.15 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  32.6 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  31.69 
 
 		 770 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.93 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  27.27 
 
 		 767 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  27.53 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  25.81 
 
 		 768 aa  68.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  29.78 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.98 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  29.24 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  30.36 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2524  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 289 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.824242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 319 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>