More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0098 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0098  ribonuclease  100 
 
 
517 aa  1054  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1609  ribonuclease  56.29 
 
 
530 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0301  ribonuclease  55.4 
 
 
503 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.58312e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2584  RNase EG  53.05 
 
 
503 aa  524  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.77215e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3239  ribonuclease G  54.62 
 
 
531 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0159  ribonuclease, Rne/Rng family  54.03 
 
 
496 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.125882  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0142  ribonuclease, Rne/Rng family  54.03 
 
 
496 aa  519  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3192  ribonuclease G  54.81 
 
 
500 aa  506  1e-142  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.45474e-07  hitchhiker  1.74098e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0350  ribonuclease  54.62 
 
 
507 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.20175e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0469  ribonuclease, Rne/Rng family  53.83 
 
 
503 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.108374  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2567  ribonuclease, Rne/Rng family  44.62 
 
 
496 aa  441  1e-122  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.894494  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2954  ribonuclease, Rne/Rng family  44.62 
 
 
496 aa  441  1e-122  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3326  ribonuclease, Rne/Rng family  44.6 
 
 
564 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0409  ribonuclease G  44.23 
 
 
492 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416814  normal  0.138989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0187  ribonuclease G  43.61 
 
 
487 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00268  ribonuclease G  44.99 
 
 
488 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0402  ribonuclease G  45.19 
 
 
489 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.124199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2536  ribonuclease  44.44 
 
 
559 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1194  ribonuclease G  45.19 
 
 
489 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00491576  hitchhiker  0.001915 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0469  ribonuclease G  45.19 
 
 
489 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0841799  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2838  ribonuclease G  44.6 
 
 
489 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.201847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3188  RNAse G  42.52 
 
 
492 aa  425  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2236  ribonuclease G  46.69 
 
 
487 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3668  ribonuclease G  44.01 
 
 
489 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.612174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3683  ribonuclease G  44.4 
 
 
489 aa  425  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3633  ribonuclease G  44.01 
 
 
489 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490544 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03681  ribonuclease G  44.4 
 
 
489 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3278  ribonuclease G  44.2 
 
 
489 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0640043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3436  ribonuclease G  44.2 
 
 
489 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0339083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3831  ribonuclease G  44.4 
 
 
489 aa  424  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0266833  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3729  ribonuclease G  44.2 
 
 
489 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0310546  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3542  ribonuclease G  44.2 
 
 
489 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0460  ribonuclease G  44.2 
 
 
489 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0238321  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0409  ribonuclease  43.25 
 
 
497 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.748202  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3562  ribonuclease G  44.01 
 
 
489 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4563  ribonuclease G  44.2 
 
 
489 aa  422  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  0.973198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03106  ribonuclease G  44.2 
 
 
489 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002387  cytoplasmic axial filament protein CafA and Ribonuclease G  44.79 
 
 
489 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3561  ribonuclease G  44.01 
 
 
489 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.026013  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0460  ribonuclease, Rne/Rng family  44.2 
 
 
489 aa  422  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.305617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3730  ribonuclease G  44.01 
 
 
489 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0965713 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0470  ribonuclease G (cytoplasmic axial filament protein)  43.05 
 
 
497 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0285908  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0482  ribonuclease  42.59 
 
 
528 aa  416  1e-115  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000399886  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0487  RNAse G  42.59 
 
 
528 aa  416  1e-115  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.258598  normal  0.0128564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3673  ribonuclease G  43.61 
 
 
489 aa  416  1e-115  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.36069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4407  ribonuclease G  44.2 
 
 
489 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0408475  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0256  ribonuclease G  43.22 
 
 
489 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0912281  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2900  ribonuclease, Rne/Rng family  43.64 
 
 
495 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12690  Ribonuclease E/G  43.97 
 
 
485 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2724  ribonuclease  45.03 
 
 
493 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.590844  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0267  ribonuclease G  43.22 
 
 
489 aa  414  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5091  cytoplasmic axial filament protein  43.19 
 
 
485 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2271  ribonuclease G  43.95 
 
 
493 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0977  ribonuclease  43.19 
 
 
485 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0944  ribonuclease  43.19 
 
 
485 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58100  cytoplasmic axial filament protein  43 
 
 
485 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5498  ribonuclease, Rne/Rng family  41.88 
 
 
543 aa  409  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0860  RNAse G  43.58 
 
 
485 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0842  RNAse G  43.19 
 
 
492 aa  407  1e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0915958  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2657  ribonuclease E and G  43.84 
 
 
490 aa  405  1e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0937  ribonuclease, Rne/Rng family  43.19 
 
 
485 aa  408  1e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0578  ribonuclease G  43.61 
 
 
502 aa  406  1e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.4987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0471  ribonuclease G  43.81 
 
 
502 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0483  ribonuclease G  43.42 
 
 
488 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.605278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1941  ribonuclease  42.77 
 
 
484 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0724052  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4556  ribonuclease G  42.04 
 
 
485 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4278  ribonuclease  43.19 
 
 
485 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0898505  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0180  ribonuclease G  38.94 
 
 
483 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377075  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2082  ribonuclease  41.6 
 
 
491 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1319  ribonuclease, Rne/Rng family  42.3 
 
 
494 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.199233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4094  ribonuclease G  43.22 
 
 
488 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0501  ribonuclease G  42.44 
 
 
502 aa  399  1e-110  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.188021  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2071  ribonuclease  40.31 
 
 
489 aa  399  1e-110  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446321  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3644  ribonuclease G  43.22 
 
 
502 aa  401  1e-110  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0556  ribonuclease G  41.99 
 
 
562 aa  399  1e-110  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1719  ribonuclease, Rne/Rng family  41.33 
 
 
495 aa  400  1e-110  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3468  ribonuclease G  43.22 
 
 
502 aa  401  1e-110  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.893805  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0696  ribonuclease G  52.28 
 
 
868 aa  400  1e-110  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01887  ribonuclease G  43.64 
 
 
499 aa  401  1e-110  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0732  ribonuclease, Rne/Rng family  52.28 
 
 
844 aa  400  1e-110  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0731  ribonuclease, Rne/Rng family  52.28 
 
 
860 aa  400  1e-110  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.767786  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1914  ribonuclease G  41.33 
 
 
495 aa  399  1e-110  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105978  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1294  ribonuclease, Rne/Rng family  40.12 
 
 
489 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.229063  normal  0.0967279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3818  ribonuclease G  42.44 
 
 
502 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0487  ribonuclease G  43.22 
 
 
489 aa  398  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0311265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0526  ribonuclease G  42.44 
 
 
488 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3527  ribonuclease  41.52 
 
 
515 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.255196  normal  0.0164409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0522  ribonuclease G  42.44 
 
 
488 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.440198  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0738  ribonuclease  52.03 
 
 
740 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0274  ribonuclease G  43.81 
 
 
491 aa  398  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4159  ribonuclease E and G  42.41 
 
 
485 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3267  ribonuclease G  40.31 
 
 
489 aa  398  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3330  ribonuclease G  41.9 
 
 
496 aa  395  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1989  ribonuclease, Rne/Rng family  43.61 
 
 
504 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3196  ribonuclease G  41.72 
 
 
517 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1126  ribonuclease G  43.64 
 
 
491 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0361848  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1975  ribonuclease G  40.86 
 
 
501 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.767333  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4468  ribonuclease G  42.41 
 
 
485 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.533978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2690  ribonuclease, Rne/Rng family  39.43 
 
 
508 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.251844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0407  ribonuclease G  43.77 
 
 
500 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.52955  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>