60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3628 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  690    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  71 
 
 		 331 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  63.14 
 
 		 331 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  31.86 
 
 		 352 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  33.23 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  32.94 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  32.34 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  32.34 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  32.65 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  32.34 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  32.05 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  32.05 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  32.35 
 
 		 341 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  32.35 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  31.45 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  31.4 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  33.43 
 
 		 340 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  31.42 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  31.31 
 
 		 354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  30.09 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 359 aa  146  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  32.18 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  29.39 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  30.67 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 359 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  28.72 
 
 		 370 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 		 370 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 370 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  27.19 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  28.53 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  29.6 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  27.93 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  29.82 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  26.88 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  23.47 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  30.91 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  24.43 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  24.71 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  26.77 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  23.62 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  26.04 
 
 		 386 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  22.08 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  19.23 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>