63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0624 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 339 aa  704    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  56.47 
 
 		 340 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  55.92 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  52.8 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  53.08 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  52.49 
 
 		 357 aa  358  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  49.7 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  46.87 
 
 		 340 aa  323  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  44.35 
 
 		 341 aa  316  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  43.75 
 
 		 341 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  44.05 
 
 		 341 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  43.75 
 
 		 341 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  43.75 
 
 		 341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  43.75 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  43.75 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  43.92 
 
 		 341 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  44.05 
 
 		 341 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  43.45 
 
 		 341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  42.14 
 
 		 342 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  43.45 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 		 371 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  33.52 
 
 		 370 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  31.59 
 
 		 387 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  33.04 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  34.21 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  32.65 
 
 		 360 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  32.75 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  30.09 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  30.12 
 
 		 331 aa  143  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  30.45 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 354 aa  93.2  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 		 354 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  26.73 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  25.34 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  26.56 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  25.51 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  24.34 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  29.23 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  21.2 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  25 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  21.09 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  29.31 
 
 		 414 aa  62  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  27.37 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  25.44 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  23.03 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  27.27 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0620  radical SAM family Fe-S protein  23.49 
 
 		 350 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.88573 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 294 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>