53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5436 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 355 aa  727    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  84.05 
 
 		 354 aa  618  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  84.9 
 
 		 354 aa  618  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  83.48 
 
 		 354 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  75.35 
 
 		 353 aa  541  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  63.07 
 
 		 359 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  62.46 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  61.76 
 
 		 358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  60.46 
 
 		 370 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  60.46 
 
 		 370 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  60.46 
 
 		 370 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  61.3 
 
 		 359 aa  438  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  46.31 
 
 		 350 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  41.47 
 
 		 291 aa  224  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  30.51 
 
 		 334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  28.95 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  29.93 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  27.44 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  25.99 
 
 		 341 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  25.99 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  25.99 
 
 		 341 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  25.99 
 
 		 341 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  25.99 
 
 		 341 aa  99.4  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  25.63 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  25.99 
 
 		 341 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  25.63 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  25.63 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  25.27 
 
 		 341 aa  96.3  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  27.56 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 339 aa  93.6  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  25.57 
 
 		 340 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  26.83 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  24.57 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  24.64 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  24.44 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  23.47 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  25.46 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  23.47 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  22.39 
 
 		 335 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  25.74 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  21.05 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  20.93 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 360 aa  46.2  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  24.32 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>