43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0709 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  100 
 
 
291 aa  593  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  24.73 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  27.55 
 
 
338 aa  79.7  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  28.81 
 
 
426 aa  77  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  27.62 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  28.01 
 
 
389 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  24.66 
 
 
335 aa  72.4  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  26.6 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  26.67 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  27.55 
 
 
371 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  23.14 
 
 
332 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  25 
 
 
375 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 
341 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 
368 aa  59.7  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  26.32 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 
294 aa  55.8  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 
340 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  24.25 
 
 
414 aa  52.8  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  23.44 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  25.15 
 
 
331 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  25 
 
 
357 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  23.84 
 
 
352 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  30.72 
 
 
297 aa  49.7  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  21.94 
 
 
300 aa  49.7  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  22.54 
 
 
340 aa  49.7  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1068  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 
354 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.829956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1467  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 
386 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0281391  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 
373 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 
294 aa  46.6  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  29.7 
 
 
359 aa  45.8  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 
350 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  23.71 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  22.54 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0818  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.957352  normal  0.655523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2166  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 
386 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.978798  hitchhiker  0.00000549931 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1659  heat shock protein HslVU, ATPase subunit HslU  35.63 
 
 
418 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  26.04 
 
 
353 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 
354 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  26.16 
 
 
340 aa  42.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0376642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>