59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0720 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  100 
 
 		 340 aa  696    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  56.47 
 
 		 339 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  51.47 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  53.24 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  51.76 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  52.03 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  47.32 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  46.36 
 
 		 341 aa  333  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  45.99 
 
 		 341 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  45.99 
 
 		 341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  43.79 
 
 		 342 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  46.45 
 
 		 341 aa  325  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  46.45 
 
 		 341 aa  325  9e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  45.1 
 
 		 341 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  45.86 
 
 		 341 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  45.99 
 
 		 341 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  46.15 
 
 		 341 aa  323  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  45.99 
 
 		 341 aa  323  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  45.99 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  45.99 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  32.57 
 
 		 371 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 387 aa  212  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  32.37 
 
 		 363 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 370 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  32.2 
 
 		 373 aa  209  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  31.14 
 
 		 359 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  32.57 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 360 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  28.94 
 
 		 376 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  29.59 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  29.29 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  30.67 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  23.13 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  21.08 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  28.85 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  21.14 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  21.14 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  21.14 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  24.75 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  24.24 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  22.34 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  20.29 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  21.24 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  28.45 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  26.7 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  24.58 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  19.8 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  22.41 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 		 368 aa  49.7  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  22.54 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  24.66 
 
 		 402 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>