62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A4334 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  98.83 
 
 
341 aa  698    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  98.83 
 
 
341 aa  698    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  99.12 
 
 
341 aa  702    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  98.83 
 
 
341 aa  698    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  99.12 
 
 
341 aa  701    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  97.65 
 
 
341 aa  691    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  97.95 
 
 
341 aa  694    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  100 
 
 
341 aa  707    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  98.83 
 
 
341 aa  699    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  96.48 
 
 
341 aa  691    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  77.42 
 
 
341 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  73.82 
 
 
342 aa  543  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  52.66 
 
 
352 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  48.68 
 
 
340 aa  340  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  50.15 
 
 
357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  46.45 
 
 
340 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  44.97 
 
 
340 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  46.8 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  43.45 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  46.11 
 
 
340 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 
371 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  37.64 
 
 
363 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 
387 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 
371 aa  229  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  36.86 
 
 
370 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 
373 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 
359 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  34.76 
 
 
376 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 
360 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  32.34 
 
 
331 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  32.35 
 
 
334 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  30.61 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 
354 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 
359 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 
355 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  27.64 
 
 
359 aa  94.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  24.82 
 
 
354 aa  94  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  27.21 
 
 
353 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 
354 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  24.58 
 
 
426 aa  87  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 
350 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  24.64 
 
 
370 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 
370 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  26.7 
 
 
389 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  26.18 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  25.5 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  25.24 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  24.88 
 
 
386 aa  63.9  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  25 
 
 
414 aa  62.8  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  21.34 
 
 
368 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  20.48 
 
 
375 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  17.93 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  19.92 
 
 
332 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  17.65 
 
 
335 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  19.59 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07430  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  23.35 
 
 
448 aa  47  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000348325  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  26.51 
 
 
375 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 
385 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>