48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2907 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 368 aa  758    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  65.38 
 
 		 375 aa  500  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  41.62 
 
 		 389 aa  298  7e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  44.52 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  32.72 
 
 		 426 aa  191  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  31.67 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  27.1 
 
 		 335 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  25.98 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  24.04 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  26.67 
 
 		 332 aa  93.2  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  24.77 
 
 		 335 aa  87.4  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  25.6 
 
 		 337 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  21.74 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  21.74 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  21.74 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  21.74 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  22.71 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  22.71 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  21.34 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  22.28 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  22.71 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  21.34 
 
 		 341 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  22.22 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  27.65 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  24.51 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  21.26 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  21.93 
 
 		 331 aa  53.9  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 341 aa  52.8  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  22.08 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  24.12 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  22.03 
 
 		 340 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  22.94 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  19.67 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  22.11 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  18.67 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  22.02 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 376 aa  43.1  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  19.18 
 
 		 350 aa  42.7  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>