64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0691 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  100 
 
 		 352 aa  730    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  60.41 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  58.06 
 
 		 357 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  58.04 
 
 		 340 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  57.91 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  52.8 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  53.25 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  53.55 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  53.85 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  53.55 
 
 		 341 aa  381  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  53.25 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  53.25 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  51.47 
 
 		 340 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  53.55 
 
 		 341 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  53.25 
 
 		 341 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  52.96 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  52.96 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  52.66 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  53.85 
 
 		 341 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  51.32 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  37.15 
 
 		 371 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  35.89 
 
 		 387 aa  235  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  36.06 
 
 		 370 aa  229  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  37.08 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  35.31 
 
 		 373 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 		 371 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 		 376 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  32.74 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  31.87 
 
 		 331 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  31.86 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  27.56 
 
 		 355 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 350 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  25.08 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  25 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  24.17 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  25.57 
 
 		 426 aa  75.9  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  24.15 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  20.85 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  28.88 
 
 		 291 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  26.84 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  21.71 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  28.5 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  21.07 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  19.83 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  19.31 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 291 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  21.43 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 297 aa  43.5  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  26.16 
 
 		 294 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>