60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1282 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  100 
 
 
426 aa  876    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  33.94 
 
 
389 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  32.32 
 
 
375 aa  203  5e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  32.72 
 
 
368 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  32.51 
 
 
371 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  34.01 
 
 
335 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  27.58 
 
 
335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  28.41 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  25.91 
 
 
332 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 
338 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  28.04 
 
 
386 aa  107  5e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  26.76 
 
 
336 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  26.07 
 
 
337 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  25.44 
 
 
342 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  24.92 
 
 
341 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  24.92 
 
 
341 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  24.92 
 
 
341 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  24.92 
 
 
341 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  24.92 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  24.92 
 
 
341 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  24.58 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  24.92 
 
 
341 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  25.25 
 
 
341 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  24.58 
 
 
341 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  26.33 
 
 
341 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  28.85 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  28.11 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  28.81 
 
 
291 aa  77  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  25.57 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 
340 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  23.78 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  25.97 
 
 
363 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  21.96 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  24.71 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  25.78 
 
 
370 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  26.64 
 
 
340 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  23.22 
 
 
353 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
341 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
359 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 
354 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
371 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 
350 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 
371 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  26.24 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  23.02 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 
373 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 
370 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  22.54 
 
 
359 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 
358 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  24 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  25.54 
 
 
291 aa  50.1  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  24.45 
 
 
376 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  21.53 
 
 
360 aa  43.5  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>