55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1936 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  100 
 
 		 371 aa  773    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  47.62 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  41.74 
 
 		 375 aa  280  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  44.52 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  32.51 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  26.83 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  29.03 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  27.18 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  24.73 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  25.28 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  25.08 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  22.04 
 
 		 337 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  26.61 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  26.61 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  26.61 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  27.04 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  26.61 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  26.61 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  26.61 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  22.46 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  26.18 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  26.61 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  25.69 
 
 		 340 aa  79.7  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  26.18 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  22.34 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  23.47 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  23.13 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  22.83 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  24.9 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  28.63 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  27.55 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  26.19 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  26.62 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  27.02 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  29.15 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 353 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  24.67 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  24.9 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  23.79 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  24.6 
 
 		 370 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  22.68 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>