63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4058 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  100 
 
 
341 aa  708    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  95.31 
 
 
341 aa  679    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  96.48 
 
 
341 aa  691    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  96.48 
 
 
341 aa  688    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  96.48 
 
 
341 aa  691    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  96.19 
 
 
341 aa  688    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  96.19 
 
 
341 aa  687    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  96.48 
 
 
341 aa  691    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  96.19 
 
 
341 aa  688    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  96.19 
 
 
341 aa  687    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  77.13 
 
 
341 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  73.24 
 
 
342 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  53.55 
 
 
352 aa  381  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  49.27 
 
 
340 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  50.73 
 
 
357 aa  328  6e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  45.99 
 
 
340 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  46.8 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  44.97 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  43.92 
 
 
339 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  47.01 
 
 
340 aa  307  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 
371 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  37.64 
 
 
363 aa  238  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 
387 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 
371 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  36.86 
 
 
370 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  36.08 
 
 
373 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 
359 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 
376 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 
360 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  32.34 
 
 
331 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  31.45 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  31.19 
 
 
331 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 
354 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 
359 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 
355 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  27.64 
 
 
359 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 
354 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  26.86 
 
 
353 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  25 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  25.25 
 
 
426 aa  88.2  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
370 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  26.7 
 
 
389 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 
354 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
370 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 
354 aa  87  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  27.04 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 
358 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  25.5 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  25.24 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  22.53 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  24.4 
 
 
386 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 
368 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  20.95 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  24.52 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  18.37 
 
 
336 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  19.92 
 
 
332 aa  52.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  20.46 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  18.01 
 
 
335 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07430  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  23.64 
 
 
448 aa  46.2  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000348325  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  26.51 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 
381 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0187919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>