62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4985 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 373 aa  746    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  69.23 
 
 		 360 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  58.9 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  61 
 
 		 359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  59.39 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  59.73 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  58.31 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  49.87 
 
 		 363 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  47.92 
 
 		 387 aa  352  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  36.65 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  35.39 
 
 		 352 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  36.93 
 
 		 341 aa  235  8e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  36.93 
 
 		 341 aa  233  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  36.93 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  36.65 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  36.65 
 
 		 341 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  36.65 
 
 		 341 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  36.65 
 
 		 341 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  36.36 
 
 		 341 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  36.65 
 
 		 341 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  36.08 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  36.36 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  33.8 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  32.49 
 
 		 340 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 357 aa  219  7.999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  36.39 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  33.71 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  31.92 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  26.33 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  30.8 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  28.68 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  25.32 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  20.14 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  24.22 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  23.86 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  28.04 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 375 aa  67  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  25 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  21.72 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 353 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  19.12 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  18.52 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 267 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  30.23 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28900  DNA repair photolyase  33.05 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.614391  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4095  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  28 
 
 		 366 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  24.86 
 
 		 414 aa  43.5  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 389 aa  43.1  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>