52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_1237 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  44.86 
 
 		 350 aa  246  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  41.52 
 
 		 354 aa  224  9e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  41.47 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  40.21 
 
 		 359 aa  222  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  39.39 
 
 		 354 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  40.07 
 
 		 353 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  40.83 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  40.14 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  40.14 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  40.14 
 
 		 370 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  40.14 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  30.32 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  29.09 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  27.93 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  24.24 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  25.9 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  25.5 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  25.5 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  28.36 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  25.5 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  25.1 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  25.1 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  25.5 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  25.5 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  25.1 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  25.1 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  25.1 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  29.23 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  26.56 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  28.88 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  22.92 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  22.05 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  27.18 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  28.8 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  22.81 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  27.62 
 
 		 341 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  28.21 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 357 aa  52.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  25.54 
 
 		 426 aa  50.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 360 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  21.98 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  26.16 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  22.9 
 
 		 381 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  26.44 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>