51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0827 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  100 
 
 		 359 aa  742    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  70.66 
 
 		 354 aa  528  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  63.53 
 
 		 354 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  66.86 
 
 		 370 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  66.86 
 
 		 370 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  66.57 
 
 		 370 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  65.92 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  68.86 
 
 		 359 aa  484  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  63.25 
 
 		 354 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  62.68 
 
 		 354 aa  487  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  63.07 
 
 		 355 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  59.77 
 
 		 353 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  42.77 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  40.21 
 
 		 291 aa  222  9e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  30.1 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  31.08 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  28.39 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  28.36 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  28.36 
 
 		 341 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  28 
 
 		 341 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  28 
 
 		 341 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  27.68 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  28.36 
 
 		 341 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  27.17 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  28 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  28 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  27.64 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  27.64 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 		 371 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  25.82 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  26.79 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 357 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  20.29 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  24.01 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  26.72 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  24.24 
 
 		 340 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  23.42 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  22.65 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  25.72 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  21.59 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  24 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  22.5 
 
 		 414 aa  46.2  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  29.7 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>