53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1066 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 387 aa  808    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  56.96 
 
 		 363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  50.39 
 
 		 371 aa  354  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  50.39 
 
 		 370 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  50.54 
 
 		 359 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  50.39 
 
 		 371 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  48.52 
 
 		 373 aa  335  7.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  47.15 
 
 		 360 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  48.16 
 
 		 376 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  37.36 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  35.71 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  35.71 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  35.71 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  35.71 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  35.71 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  35.71 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  35.44 
 
 		 341 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  35.71 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  35.89 
 
 		 352 aa  235  8e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  35.44 
 
 		 341 aa  235  9e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  35.16 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  33.79 
 
 		 342 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  34.15 
 
 		 340 aa  212  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  31.59 
 
 		 339 aa  206  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  31.35 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  34.07 
 
 		 340 aa  196  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  26.59 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  24.1 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  23.55 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  26.27 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  22.79 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  24.48 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  23.65 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  26.29 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  23.92 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  22.78 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  23.31 
 
 		 375 aa  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  22.94 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  22.45 
 
 		 353 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>