53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1857 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 354 aa  738    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  70.66 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  65.34 
 
 		 359 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  60.73 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  61.58 
 
 		 354 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  62.46 
 
 		 355 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  60.45 
 
 		 354 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  61.82 
 
 		 358 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  61.43 
 
 		 370 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  61.43 
 
 		 370 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  61.14 
 
 		 370 aa  455  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  60.63 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  46.61 
 
 		 350 aa  312  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  41.52 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  31.4 
 
 		 334 aa  157  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  28.87 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  28.3 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  27.01 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  28.47 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  28.1 
 
 		 341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  28.1 
 
 		 341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  28.1 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  28.1 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  28.1 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  28.47 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  28.47 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  27.74 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  27.37 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  24.14 
 
 		 341 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  26.79 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  29.26 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  24.46 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  24.37 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  23.13 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 		 357 aa  90.1  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  22.47 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  25.44 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  21.98 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  24.52 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  20.51 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  24.63 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  19.13 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  20.9 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  22.68 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  24.04 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>