52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3293 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  100 
 
 
363 aa  752    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  56.96 
 
 
387 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  54.04 
 
 
370 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  54.44 
 
 
371 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  52.78 
 
 
371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  52.65 
 
 
359 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  50.28 
 
 
373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  52.2 
 
 
360 aa  339  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  50.82 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  36.68 
 
 
342 aa  238  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  37.64 
 
 
341 aa  238  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  37.64 
 
 
341 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  37.64 
 
 
341 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  37.64 
 
 
341 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  37.64 
 
 
341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  37.64 
 
 
341 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  37.36 
 
 
341 aa  235  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  37.36 
 
 
341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  37.36 
 
 
341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  38.11 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  37.93 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  37.93 
 
 
341 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  37.08 
 
 
352 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  32.37 
 
 
340 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  37.43 
 
 
340 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 
340 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 
339 aa  205  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  33.71 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
341 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  26.38 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  26.24 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  27.19 
 
 
334 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  25.97 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  26.82 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  21.98 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  23.42 
 
 
359 aa  62.8  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 
368 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  25.12 
 
 
375 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  23.27 
 
 
335 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  19.77 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 
350 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  20.56 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  20.56 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  20.56 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  23.79 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  21.98 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  20.9 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 
354 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  24.37 
 
 
414 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>