55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3457 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  94.35 
 
 		 354 aa  691    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  99.15 
 
 		 354 aa  726    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 354 aa  729    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  84.05 
 
 		 355 aa  618  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  76.64 
 
 		 353 aa  565  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  63.53 
 
 		 359 aa  491  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  63.32 
 
 		 358 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  61.6 
 
 		 370 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  61.6 
 
 		 370 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  61.6 
 
 		 370 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  60.73 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  61.32 
 
 		 359 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  45.29 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  40.07 
 
 		 291 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  31.31 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  29.11 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  28.72 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  25.55 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  27.64 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  24.45 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  24.45 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  24.45 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  24.45 
 
 		 341 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  24.45 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  24.45 
 
 		 341 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  24.09 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  24.09 
 
 		 341 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  24.09 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  23.72 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  24.73 
 
 		 340 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  24.59 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  22.48 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  23.6 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  22.6 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  21.51 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  25.48 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  20.74 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  26.64 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 		 387 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  24.51 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  20.15 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  23.69 
 
 		 414 aa  49.7  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  23.19 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  22.22 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  19.78 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>