60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1929 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  100 
 
 		 335 aa  671    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  26.83 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  30.11 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  34.01 
 
 		 426 aa  138  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  27.71 
 
 		 414 aa  126  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  33.65 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  28.62 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  30.7 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  31.14 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  26.52 
 
 		 386 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  27.39 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  27.97 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  30.91 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  28.31 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  24.15 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  21.55 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  22.11 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  25.71 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  20.16 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  25.71 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  25.71 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  25.71 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  25.71 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  25.71 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  25.71 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  20.88 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  25.59 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  25.24 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  28.45 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  21.72 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  27.66 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  25.24 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  25.24 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  25.49 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  20.16 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  20.97 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  21.51 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  25.51 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  23.27 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  20.51 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  21.83 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  21.59 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 359 aa  52.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  21.79 
 
 		 360 aa  52.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  22.1 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>