56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2665 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  100 
 
 		 370 aa  764    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 370 aa  764    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  99.73 
 
 		 370 aa  762    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  81.87 
 
 		 358 aa  617  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  66.86 
 
 		 359 aa  492  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  65.45 
 
 		 359 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  61.6 
 
 		 354 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  61.6 
 
 		 354 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  61.32 
 
 		 354 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  61.43 
 
 		 354 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  60.46 
 
 		 355 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  60.06 
 
 		 353 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  47.65 
 
 		 350 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  40.14 
 
 		 291 aa  195  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  26.82 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  28.72 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  27.36 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 		 341 aa  93.2  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 		 341 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 		 341 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 341 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 341 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 341 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 341 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 		 341 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  24.64 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  24.64 
 
 		 341 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  23.91 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 339 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  21.14 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 357 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  23.69 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  23.88 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  20.81 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  26.64 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  25.51 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  23.02 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  23.89 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  20.56 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  20.56 
 
 		 338 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  24.6 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  23.12 
 
 		 386 aa  46.2  0.0009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  21.88 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  21.61 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  22.02 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>