61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2341 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  100 
 
 
357 aa  728    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  58.06 
 
 
352 aa  421  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  55.2 
 
 
341 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  55.46 
 
 
340 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  52.49 
 
 
339 aa  368  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  51.16 
 
 
340 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  52.19 
 
 
340 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  52.82 
 
 
340 aa  363  2e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  50.73 
 
 
342 aa  348  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  50.73 
 
 
341 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  50.44 
 
 
341 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  50.44 
 
 
341 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  50.15 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  50.44 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  50.15 
 
 
341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  50.15 
 
 
341 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  50.44 
 
 
341 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  50.44 
 
 
341 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  50.15 
 
 
341 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  48.97 
 
 
341 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  38.11 
 
 
363 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 
387 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 
371 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  37.11 
 
 
370 aa  219  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 
373 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  36.26 
 
 
359 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  37.01 
 
 
371 aa  209  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 
360 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 
376 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  33.04 
 
 
331 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  31.47 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  30.29 
 
 
331 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 
354 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 
359 aa  96.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  27.97 
 
 
353 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 
354 aa  87  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  25.44 
 
 
354 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  25.24 
 
 
371 aa  86.3  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  25.57 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 
370 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  25.98 
 
 
359 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  23.65 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 
358 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  23.94 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  29.95 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  24.28 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  25.09 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  23.11 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  23.85 
 
 
337 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  18.98 
 
 
375 aa  63.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  22.45 
 
 
368 aa  59.7  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  25.7 
 
 
291 aa  57  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  24.86 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1281  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
294 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  19.7 
 
 
335 aa  50.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  25.6 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  27.35 
 
 
386 aa  43.5  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>