64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4278 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  98.83 
 
 		 341 aa  699    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  98.83 
 
 		 341 aa  699    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  99.12 
 
 		 341 aa  702    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  98.83 
 
 		 341 aa  699    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  96.19 
 
 		 341 aa  688    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  100 
 
 		 341 aa  707    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  98.83 
 
 		 341 aa  699    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  98.83 
 
 		 341 aa  702    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  98.24 
 
 		 341 aa  696    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  99.12 
 
 		 341 aa  701    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  77.71 
 
 		 341 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  73.82 
 
 		 342 aa  544  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  53.55 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  49.27 
 
 		 340 aa  345  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  50.15 
 
 		 357 aa  327  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  45.27 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  46.45 
 
 		 340 aa  325  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  46.8 
 
 		 341 aa  322  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  43.75 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  46.71 
 
 		 340 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 371 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 387 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  37.64 
 
 		 363 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  37.14 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  36.93 
 
 		 373 aa  222  9e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 376 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  32.94 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  32.65 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  31.46 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  29.39 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 355 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  28 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 353 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  24.45 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  24.45 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  27.18 
 
 		 389 aa  90.1  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  24.92 
 
 		 426 aa  89.7  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  25 
 
 		 370 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 370 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  26.61 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  25.5 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  25.71 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  25.36 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  25 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  20.95 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  20.31 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  18.37 
 
 		 336 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  18.01 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  20.08 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 375 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07430  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  25.81 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000348325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 381 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  26.98 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>