55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0830 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 376 aa  743    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  77.72 
 
 		 370 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  77.24 
 
 		 371 aa  554  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  77.24 
 
 		 371 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  75.21 
 
 		 359 aa  511  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  58.47 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  55.15 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  50.82 
 
 		 363 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  48.42 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  38.68 
 
 		 341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  36.24 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  36.47 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  36.47 
 
 		 341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  36.47 
 
 		 341 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  36.47 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  35.71 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  36.47 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  36.47 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  36.47 
 
 		 341 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  36.47 
 
 		 341 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  36.18 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  35.9 
 
 		 342 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  33.8 
 
 		 357 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  32.86 
 
 		 339 aa  203  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  37.28 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  30 
 
 		 340 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  30.48 
 
 		 340 aa  185  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  30.46 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  28.53 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  26.74 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  27.34 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  26.04 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  26.15 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  25.09 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  20.48 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  29.15 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  24.17 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  22.05 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  25.83 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  24.1 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  25.46 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 375 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  24.45 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 355 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  24.62 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>