73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22270 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  100 
 
 		 340 aa  699    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  53.85 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  51.76 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  51.78 
 
 		 340 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  51.16 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  49.7 
 
 		 339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  51.38 
 
 		 340 aa  346  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  49.27 
 
 		 341 aa  345  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  49.27 
 
 		 341 aa  345  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  48.97 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  48.97 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  49.27 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  49.27 
 
 		 341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  48.97 
 
 		 341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  48.68 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  48.68 
 
 		 341 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  48.68 
 
 		 341 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  48.26 
 
 		 341 aa  332  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  45.75 
 
 		 341 aa  328  7e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  46.15 
 
 		 342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4985  Radical SAM domain protein  33.52 
 
 		 373 aa  215  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.831424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  32.66 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2839  radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95751  normal  0.218512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  33.71 
 
 		 363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1066  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2717  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.37756  normal  0.372526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4460  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 		 360 aa  195  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.26561  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0830  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 		 376 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0103728 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  32.65 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  31.07 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  29.39 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  23.38 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  21.97 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  28.11 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  25.69 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2339  radical SAM domain-containing protein  20.73 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  26.56 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  20.81 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  20.81 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  28.48 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  20.47 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  27.66 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0354  radical SAM domain-containing protein  21.92 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360809  normal  0.699782 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  23.05 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  21.85 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  27.01 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  21.33 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  22.54 
 
 		 291 aa  49.7  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3344  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000768449  normal  0.0781434 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1011  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1743  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 375 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.106017  normal  0.444535 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  21.68 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2104  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 380 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124136  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1768  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.938086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1725  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1963  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.003672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  18.67 
 
 		 368 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>