282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1649 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1649  Methyltransferase type 12  100 
 
 
200 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.70723e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  70 
 
 
200 aa  293  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  32.21 
 
 
210 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  34.43 
 
 
204 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  32.56 
 
 
208 aa  97.8  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  29.67 
 
 
218 aa  94.7  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  32.45 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  30.37 
 
 
219 aa  88.2  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  30.11 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
218 aa  85.5  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
219 aa  81.3  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  28.73 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  29.28 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  29.47 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  30.62 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  29.88 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  25.57 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  29.41 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  28.82 
 
 
307 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
348 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
304 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  28.5 
 
 
200 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  26.6 
 
 
312 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.02 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  26.71 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
305 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
317 aa  55.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  27.66 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  26.99 
 
 
271 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  25.16 
 
 
305 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  29.13 
 
 
2112 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.04 
 
 
155 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.76 
 
 
228 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  25.12 
 
 
258 aa  52.4  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
305 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 
239 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
309 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  26.74 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
239 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  25 
 
 
241 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 
291 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
258 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  24.6 
 
 
201 aa  51.2  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3753  methyltransferase type 12  28.85 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  22.45 
 
 
262 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  24.31 
 
 
349 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.49 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  30.77 
 
 
326 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1569  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  27.2 
 
 
524 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
238 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  32.04 
 
 
308 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  25.4 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  23.27 
 
 
307 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.03 
 
 
245 aa  49.3  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  27.04 
 
 
210 aa  48.9  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
254 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1378  Methyltransferase type 11  24.65 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
258 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  27.14 
 
 
249 aa  48.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  25.97 
 
 
339 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
254 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
236 aa  48.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  26.09 
 
 
336 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.22 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  21.43 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  21.43 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
238 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.3 
 
 
258 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
315 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.29 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  24.32 
 
 
217 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  24.32 
 
 
349 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
330 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.93 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
311 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
312 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  27.94 
 
 
195 aa  47  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 
247 aa  47  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  24.32 
 
 
354 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0256  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.39 
 
 
238 aa  47  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.757701  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.37 
 
 
262 aa  47  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  23.31 
 
 
210 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  29.2 
 
 
436 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
249 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
331 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  25 
 
 
334 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  23.24 
 
 
342 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  25.99 
 
 
340 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>