251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1188 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  100 
 
 
214 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  44.44 
 
 
232 aa  168  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  44.12 
 
 
213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  41.4 
 
 
216 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  42.58 
 
 
215 aa  157  8e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  39.53 
 
 
216 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  40.19 
 
 
215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  37.56 
 
 
223 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  40.5 
 
 
218 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  39.25 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  39.34 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  38.35 
 
 
218 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  39.42 
 
 
215 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  38.92 
 
 
195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  33.49 
 
 
215 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  38.38 
 
 
195 aa  138  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  33.01 
 
 
215 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  35.85 
 
 
215 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  33.01 
 
 
215 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  35.38 
 
 
215 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  33.01 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  33.01 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  33.01 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  36.49 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  38.1 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  32.54 
 
 
215 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  38.73 
 
 
208 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  35.38 
 
 
215 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0662  hemolysin III  37.14 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.503531  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2390  hemolysin III  37.14 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3310  channel protein, hemolysin III family  36.19 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.837096 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0804  hemolysin III  37.14 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1179  hemolysin III  37.14 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1104  hemolysin III  37.14 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1768  hemolysin III  37.14 
 
 
206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0452  HylII  35.24 
 
 
204 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002051  hypothetical protein  37.67 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0649  putative hemolysin HylII  36.19 
 
 
206 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.426321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1597  hemolysin III  36.67 
 
 
206 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3442  HylII  37.02 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5077  hemolysin III  35.71 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0427  hemolysin III family channel protein  36.19 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.622641 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3247  hemolysin III family channel protein  36.19 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888973  normal  0.330902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0099  hemolysin HylII family protein  35.71 
 
 
206 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  36.76 
 
 
209 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3370  hemolysin III family channel protein  36.41 
 
 
205 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339431  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5431  hemolysin III family channel protein  36.32 
 
 
206 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5300  hemolysin III family channel protein  36.19 
 
 
206 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.503604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4712  hemolysin III family channel protein  36.19 
 
 
206 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.859483  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4883  hemolysin III family channel protein  36.32 
 
 
206 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0623487  normal  0.221133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5560  hemolysin III family channel protein  36.19 
 
 
206 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5292  HylII  36.41 
 
 
205 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.976162  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  34.11 
 
 
219 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  38.92 
 
 
366 aa  122  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  35.71 
 
 
206 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4730  hemolysin III family channel protein  37.38 
 
 
205 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  37.21 
 
 
233 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  37.5 
 
 
268 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0342  hemolysin III family channel protein  37.07 
 
 
219 aa  122  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.80447  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0807  hemolysin III family channel protein  34.78 
 
 
220 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0367695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3900  hemolysin III family channel protein  35.07 
 
 
224 aa  121  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0752  hemolysin III family channel protein  37.14 
 
 
220 aa  121  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.67077  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0478  hemolysin III family channel protein  36.41 
 
 
205 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5036  hemolysin III family channel protein  35.71 
 
 
205 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406448  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  41.48 
 
 
215 aa  121  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  36.79 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  32.69 
 
 
221 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5552  putative lipoprotein  35.44 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63900  putative hemolyin III  36.41 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4986  hemolysin III family channel protein  35.24 
 
 
205 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0394739  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  36.79 
 
 
215 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51760  hemolysin III  34.62 
 
 
205 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0720  hemolysin III  34.8 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4860  hemolysin III family channel protein  35.24 
 
 
205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.855318  normal  0.0154668 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  38.03 
 
 
216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  32.57 
 
 
305 aa  118  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  36.97 
 
 
216 aa  118  7e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3907  channel protein, hemolysin III family  37.98 
 
 
214 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3307  channel protein, hemolysin III family  37.44 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3386  hemolysin-3  34.12 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3281  hemolysin-3  34.12 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3218  hemolysin-3  34.12 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3206  hemolysin-3  34.12 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3284  hemolysin-3  34.12 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  37.14 
 
 
205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0810  hemolysin III family channel protein  34.6 
 
 
219 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.558375  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  34.6 
 
 
219 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02731  predicted oxidoreductase, inner membrane subunit  34.6 
 
 
219 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.598213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0793  channel protein, hemolysin III family  34.6 
 
 
219 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  34.6 
 
 
219 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02694  hypothetical protein  34.6 
 
 
219 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  34.6 
 
 
219 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  34.6 
 
 
219 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3032  hemolysin III family channel protein  34.6 
 
 
219 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  34.78 
 
 
226 aa  115  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2707  hemolysin-like protein  37.2 
 
 
218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.11717  normal  0.834021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  35.33 
 
 
224 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01677  hemolysin III  34.15 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3317  hemolysin III family channel protein  34.13 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1178  hemolysin III family channel protein  34.78 
 
 
215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>