More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0378 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
706 aa  1449  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  42.31 
 
 
679 aa  514  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  42.56 
 
 
679 aa  514  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  42.05 
 
 
680 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  42.47 
 
 
680 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  42.47 
 
 
673 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.33103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  42.47 
 
 
673 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  42.47 
 
 
667 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.44476e-08 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  42.63 
 
 
680 aa  508  1e-142  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.66869e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  42.47 
 
 
680 aa  508  1e-142  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  6.91863e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  42.31 
 
 
680 aa  506  1e-142  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  1.38665e-10 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  42.47 
 
 
680 aa  507  1e-142  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  44.28 
 
 
905 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  41.51 
 
 
761 aa  465  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  43.87 
 
 
705 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  37.34 
 
 
775 aa  455  1e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.95 
 
 
685 aa  452  1e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  41.1 
 
 
705 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  39.34 
 
 
765 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  40.2 
 
 
746 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  41.28 
 
 
746 aa  430  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  41.28 
 
 
705 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  41.28 
 
 
705 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  41.28 
 
 
705 aa  429  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  41.68 
 
 
727 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  41.28 
 
 
705 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  41.28 
 
 
705 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  41.28 
 
 
705 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  41.1 
 
 
705 aa  426  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  38.17 
 
 
727 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  40.69 
 
 
880 aa  417  1e-115  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  37.98 
 
 
828 aa  416  1e-115  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  36.02 
 
 
773 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.38 
 
 
743 aa  411  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  37.2 
 
 
721 aa  409  1e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  40.48 
 
 
709 aa  402  1e-110  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.81 
 
 
687 aa  393  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  37.68 
 
 
795 aa  385  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  4.6818e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.93 
 
 
806 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  36.34 
 
 
829 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1213  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.49 
 
 
686 aa  356  7e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  35.47 
 
 
830 aa  347  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  35.35 
 
 
912 aa  347  5e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  35.41 
 
 
820 aa  343  6e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  35.41 
 
 
846 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  33.99 
 
 
814 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  35.16 
 
 
832 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  36.26 
 
 
836 aa  342  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  35.26 
 
 
834 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.15 
 
 
661 aa  341  3e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  36.19 
 
 
901 aa  341  3e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  36.58 
 
 
648 aa  340  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  36.68 
 
 
776 aa  339  1e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  34.95 
 
 
834 aa  339  1e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  34.63 
 
 
835 aa  337  3e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  34.63 
 
 
837 aa  338  3e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  34.38 
 
 
839 aa  337  6e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  35 
 
 
837 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  35.68 
 
 
640 aa  334  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.85 
 
 
648 aa  333  5e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  37.21 
 
 
761 aa  333  6e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  34.1 
 
 
843 aa  332  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  34.7 
 
 
658 aa  332  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  33.43 
 
 
755 aa  331  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0346  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.54 
 
 
863 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  34.67 
 
 
647 aa  328  2e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  35.59 
 
 
824 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  34.5 
 
 
897 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  34.17 
 
 
900 aa  327  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  32.87 
 
 
941 aa  326  8e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  34.17 
 
 
897 aa  326  9e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  34.17 
 
 
896 aa  326  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  34.17 
 
 
897 aa  326  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  34.17 
 
 
897 aa  326  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  37.91 
 
 
712 aa  325  1e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  36.11 
 
 
626 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  35.45 
 
 
618 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  34.31 
 
 
794 aa  325  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  34 
 
 
905 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  34.17 
 
 
897 aa  325  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 
914 aa  324  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.27 
 
 
824 aa  324  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.17 
 
 
640 aa  323  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  35.1 
 
 
720 aa  322  1e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  36.05 
 
 
691 aa  322  2e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  32.15 
 
 
811 aa  322  2e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.94 
 
 
734 aa  321  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  35.93 
 
 
649 aa  320  5e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  34.76 
 
 
739 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  34.75 
 
 
602 aa  318  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  33.87 
 
 
643 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  34 
 
 
824 aa  317  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  33.94 
 
 
638 aa  317  7e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  36.87 
 
 
775 aa  316  8e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21042e-11 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  35.39 
 
 
735 aa  315  1e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  35.08 
 
 
643 aa  315  1e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  35.08 
 
 
643 aa  315  1e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.29 
 
 
646 aa  314  3e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.46416e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  33.73 
 
 
865 aa  313  5e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.02 
 
 
714 aa  313  7e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>