More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1070 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 565 aa  1155    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  58.69 
 
 		 559 aa  667    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  57.62 
 
 		 561 aa  653    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  52.3 
 
 		 566 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  50.95 
 
 		 577 aa  586  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  52.73 
 
 		 578 aa  585  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  51.64 
 
 		 591 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  54.81 
 
 		 549 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  51.75 
 
 		 590 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.62 
 
 		 561 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.19 
 
 		 561 aa  552  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  48.41 
 
 		 569 aa  554  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.62 
 
 		 561 aa  551  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.61 
 
 		 582 aa  550  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.96 
 
 		 563 aa  551  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.96 
 
 		 563 aa  551  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  50.9 
 
 		 557 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.79 
 
 		 563 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.79 
 
 		 563 aa  546  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.79 
 
 		 582 aa  546  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.09 
 
 		 561 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.27 
 
 		 561 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  48.09 
 
 		 583 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  48.5 
 
 		 573 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.39 
 
 		 585 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  47.11 
 
 		 584 aa  514  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  49.35 
 
 		 539 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  46.47 
 
 		 551 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  45.96 
 
 		 585 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  46.24 
 
 		 564 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  45.31 
 
 		 575 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  45.12 
 
 		 584 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  47.22 
 
 		 558 aa  465  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  45.28 
 
 		 543 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  43.73 
 
 		 560 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  43.55 
 
 		 583 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  42.29 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 		 561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 		 559 aa  442  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  46.57 
 
 		 560 aa  442  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 		 559 aa  443  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 		 584 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  43.38 
 
 		 584 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  43.38 
 
 		 584 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.93 
 
 		 565 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.73 
 
 		 566 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  41.92 
 
 		 561 aa  435  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.75 
 
 		 565 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.01 
 
 		 560 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 		 579 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.58 
 
 		 565 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  42.96 
 
 		 584 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 		 579 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.67 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.01 
 
 		 560 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  42.78 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3249  AMP-dependent synthetase and ligase  40.25 
 
 		 572 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0843615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 		 549 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  41.61 
 
 		 569 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  41.49 
 
 		 561 aa  432  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  41.39 
 
 		 583 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.28 
 
 		 572 aa  430  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.02 
 
 		 563 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.39 
 
 		 573 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.1 
 
 		 561 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.46 
 
 		 565 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.1 
 
 		 561 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.49 
 
 		 561 aa  432  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  43.1 
 
 		 564 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.1 
 
 		 561 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.39 
 
 		 583 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3752  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 557 aa  430  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.49 
 
 		 561 aa  432  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.49 
 
 		 561 aa  432  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.09 
 
 		 565 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0138  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.55 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938727  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.49 
 
 		 561 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.1 
 
 		 561 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  41.49 
 
 		 561 aa  432  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3572  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  40.5 
 
 		 557 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.02 
 
 		 572 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  40.78 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.4 
 
 		 563 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1720  AMP-dependent synthetase and ligase  42.23 
 
 		 586 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.976205  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  42.94 
 
 		 554 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.92 
 
 		 561 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.99 
 
 		 557 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.71 
 
 		 569 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.71 
 
 		 562 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  40.71 
 
 		 567 aa  425  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  40.67 
 
 		 569 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.89 
 
 		 557 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  40.21 
 
 		 562 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.71 
 
 		 562 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  42.4 
 
 		 601 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.81 
 
 		 557 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.81 
 
 		 557 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.88 
 
 		 562 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.88 
 
 		 562 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>