171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0086 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  401  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  43.23 
 
 
206 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  39.23 
 
 
192 aa  118  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  34.62 
 
 
192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  33.71 
 
 
279 aa  92.8  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  36.16 
 
 
224 aa  91.7  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  33.57 
 
 
211 aa  88.6  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  33.52 
 
 
250 aa  85.9  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  33.79 
 
 
230 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2281  protein of unknown function DUF305  29.61 
 
 
180 aa  82  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0018571  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  32.92 
 
 
246 aa  79  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1150  hypothetical protein  29.81 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  31.48 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  29.88 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  27.27 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2280  protein of unknown function DUF305  30.08 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000158404  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  27.67 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  28.66 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  28.66 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  30.3 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1313  hypothetical protein  27.27 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1810  protein of unknown function DUF305  26.15 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  37.31 
 
 
134 aa  62.8  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  25.66 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  47.37 
 
 
126 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  43.84 
 
 
139 aa  62  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1473  hypothetical protein  29.37 
 
 
253 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.49823  normal  0.238367 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  25 
 
 
206 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  42.86 
 
 
134 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  43.1 
 
 
117 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  29.07 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 
132 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  39.47 
 
 
116 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  31.51 
 
 
206 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  29.45 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.73 
 
 
517 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  43.86 
 
 
128 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  40.58 
 
 
113 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  29.53 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  39.71 
 
 
120 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2213  hypothetical protein  30.67 
 
 
241 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  29.66 
 
 
208 aa  58.2  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  34.48 
 
 
119 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  29.22 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  39.06 
 
 
128 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  25.94 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0047  hypothetical protein  38.95 
 
 
232 aa  56.6  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  31.73 
 
 
135 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  40.62 
 
 
122 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  39.68 
 
 
134 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  36.51 
 
 
134 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  38.03 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  41.1 
 
 
147 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4389  hypothetical protein  26.43 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  27.66 
 
 
210 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  37.68 
 
 
132 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  40.35 
 
 
128 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  37.04 
 
 
152 aa  54.7  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5740  hypothetical protein  28.48 
 
 
199 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  33.33 
 
 
119 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  43.06 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  41.18 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4915  hypothetical protein  29.29 
 
 
370 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  40.35 
 
 
137 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  39.66 
 
 
131 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  25.49 
 
 
210 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  24.86 
 
 
237 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  24.69 
 
 
217 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  40.98 
 
 
213 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0706  hypothetical protein  30.14 
 
 
203 aa  51.6  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  24.21 
 
 
226 aa  51.6  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4526  hypothetical protein  38.1 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410166  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  38.6 
 
 
142 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2645  hypothetical protein  27.98 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2059  protein of unknown function DUF305  27.21 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
148 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  37.08 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  36.84 
 
 
131 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  37.08 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  37.08 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4415  protein of unknown function DUF305  29.58 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  27.27 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2111  hypothetical protein  27.03 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0727975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3655  hypothetical protein  28.1 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  40.35 
 
 
133 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
125 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  28.1 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5683  hypothetical protein  41.38 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5327  hypothetical protein  41.38 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4157  protein of unknown function DUF305  38.71 
 
 
217 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.427773  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2245  hypothetical protein  26.97 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19318  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6146  putative secreted protein  27.46 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.0345137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  38.89 
 
 
229 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1394  hypothetical protein  38.71 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4859  hypothetical protein  26.67 
 
 
179 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.465099  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  38.89 
 
 
231 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  33.73 
 
 
127 aa  48.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  33.73 
 
 
127 aa  48.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  38.89 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1810  protein of unknown function DUF305  39.34 
 
 
257 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>