More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0161 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 640 aa  1312    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  56.05 
 
 		 602 aa  695    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  62.32 
 
 		 755 aa  789    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  63.13 
 
 		 595 aa  736    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  48.81 
 
 		 600 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  49.65 
 
 		 597 aa  560  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  37.96 
 
 		 634 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 		 643 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 		 646 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 645 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 		 642 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.77 
 
 		 639 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 		 636 aa  369  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  39.72 
 
 		 611 aa  364  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  33.99 
 
 		 647 aa  364  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 		 633 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 		 609 aa  363  7.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  35.52 
 
 		 628 aa  357  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.17 
 
 		 619 aa  355  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  36.54 
 
 		 619 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 		 648 aa  348  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  35.35 
 
 		 648 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  35.35 
 
 		 648 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 648 aa  345  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  35.36 
 
 		 624 aa  343  5.999999999999999e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  34.96 
 
 		 640 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 637 aa  340  4e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  35.94 
 
 		 645 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 		 630 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  33.6 
 
 		 673 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.92 
 
 		 636 aa  335  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  37.23 
 
 		 627 aa  333  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  36.47 
 
 		 646 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  36.26 
 
 		 681 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  32.77 
 
 		 574 aa  331  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 		 662 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 		 630 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  36.47 
 
 		 646 aa  330  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  33.9 
 
 		 629 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 		 678 aa  329  8e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  33.9 
 
 		 629 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  33.84 
 
 		 629 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  33.12 
 
 		 629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  34.24 
 
 		 662 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  34.1 
 
 		 647 aa  328  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  33.9 
 
 		 664 aa  325  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  36.12 
 
 		 631 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  35.27 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  34.36 
 
 		 602 aa  324  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  34.36 
 
 		 602 aa  324  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.95 
 
 		 618 aa  323  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  32.64 
 
 		 766 aa  323  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 793 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  33.44 
 
 		 801 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  32.53 
 
 		 689 aa  322  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 		 607 aa  321  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  31.89 
 
 		 608 aa  320  3.9999999999999996e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 		 618 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  35.1 
 
 		 626 aa  318  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 		 703 aa  316  7e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  35.58 
 
 		 631 aa  316  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0670  penicillin-binding protein 2  33.78 
 
 		 607 aa  316  9e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.265055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  35.93 
 
 		 630 aa  316  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 610 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 649 aa  315  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 634 aa  315  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.27 
 
 		 641 aa  315  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  35.58 
 
 		 631 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1073  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 604 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  34.69 
 
 		 681 aa  313  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  33.66 
 
 		 638 aa  313  6.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  33.55 
 
 		 637 aa  313  9e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 626 aa  312  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  33.44 
 
 		 629 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  31.69 
 
 		 588 aa  311  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0309  penicillin-binding protein 2  32.59 
 
 		 608 aa  311  2e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.244318  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0680  penicillin-binding protein 2  32.26 
 
 		 601 aa  311  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.104007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  32.39 
 
 		 643 aa  310  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 		 647 aa  310  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 		 646 aa  310  6.999999999999999e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  32.84 
 
 		 634 aa  310  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  33.71 
 
 		 629 aa  309  9e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0755  penicillin-binding protein 2  31.92 
 
 		 599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  32.94 
 
 		 610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.37 
 
 		 640 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  34.88 
 
 		 658 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  33.01 
 
 		 631 aa  307  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  32.52 
 
 		 771 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0450  penicillin-binding protein 2  32.37 
 
 		 609 aa  306  6e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1995  penicillin-binding protein 2  32.66 
 
 		 607 aa  306  6e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  33.12 
 
 		 801 aa  306  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  34.8 
 
 		 655 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  32.85 
 
 		 631 aa  306  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  30.65 
 
 		 691 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  32.85 
 
 		 631 aa  306  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  32.69 
 
 		 631 aa  306  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  33.89 
 
 		 627 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  31.92 
 
 		 601 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  31.7 
 
 		 628 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  32.63 
 
 		 633 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>